More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4215 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  100 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  38.16 
 
 		 234 aa  132  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  29.6 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  38.56 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.98 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.71 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  28.95 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2362  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.18 
 
 		 276 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.74 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.86 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 245 aa  98.2  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2525  HAD family hydrolase  35.37 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  24.89 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.01 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.91 
 
 		 274 aa  93.2  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  27.39 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  38.1 
 
 		 261 aa  88.6  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.72 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.1 
 
 		 244 aa  85.5  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00240  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.18 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  31.71 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  30.13 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  27.43 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  25.82 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.32 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  29.69 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  29.33 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  27.6 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.08 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  27.6 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  29.69 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  26.92 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  27.6 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  25.58 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  26.7 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  26.22 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  26.22 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  26.22 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  26.22 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  26.22 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  33.5 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  27.15 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  25.21 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  26.42 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  26.42 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  25.76 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  24.12 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  25.22 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  27.8 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  24.78 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  27.56 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  43 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.25 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  24.34 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  30.13 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  26.58 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  25.11 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  25.11 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  33.64 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  25.11 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.11 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  25.11 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  29.51 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  25.56 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  26.07 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  25.11 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  25.56 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.78 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  25.56 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  24.59 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  21.08 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  20.87 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  27.5 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  19.91 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  23.29 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  24.87 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  27.88 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  22.47 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  27.17 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  24.89 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  29.46 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  23.04 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  28.26 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.13 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  20.7 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  24.24 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  23.88 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.42 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  24.12 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  20.85 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.17 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  20.85 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  20.09 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  27.84 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  29.44 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  19.91 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  25.86 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>