More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2297 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 268 aa  538  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.24 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.49 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.14 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  34.63 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.73 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.2 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.33 
 
 		 234 aa  99.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.62 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2525  HAD family hydrolase  31.4 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.68 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.76 
 
 		 227 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.95 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2362  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.82 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  38.58 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  23.11 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  30.49 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.81 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  37.8 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  27.31 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  23.6 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00240  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.45 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  26.19 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  28.36 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  29.6 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.1 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  31.3 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  35.16 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  29.39 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.56 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  26.48 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.4 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.9 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  23.79 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  26.49 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  20.18 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  31.01 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  27.05 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  24.65 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  31.58 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  30.87 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  34.78 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  34.11 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  23.9 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.8 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1511  HAD family hydrolase  36.97 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1799  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  33.87 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  30.09 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  31.51 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  23.41 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  24.11 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.78 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  32.02 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  36.67 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  35.9 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  35.66 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  35.04 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  34.17 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  29.59 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  29.59 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  26.36 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  28.89 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0628  HAD family hydrolase  33.93 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  24.5 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.01 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  26.36 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  25.73 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.23 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  24.02 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  28.3 
 
 		 234 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.7 
 
 		 235 aa  62  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 		 238 aa  62  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  31.33 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  30.1 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  25.11 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.3 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  35.58 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.28 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  25.89 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  35.29 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  25.64 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  23.39 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  30.23 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  23.39 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1444  HAD superfamily hydrolase  32.2 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000160322  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  33.59 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  23.39 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  27.65 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  22.82 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.27 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  27.83 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  30.23 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  31.2 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  25.24 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>