More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0889 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
221 aa  424  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.24 
 
 
250 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.7 
 
 
216 aa  127  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.75 
 
 
217 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3065  HAD family hydrolase  41.18 
 
 
214 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3292  HAD family hydrolase  41.12 
 
 
214 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.49 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  36.97 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  40.46 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  40.46 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  40.46 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  40.46 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  40.46 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  38.06 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  40.98 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  40.98 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  38.81 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  38.81 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  40.98 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.98 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  40.98 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  25.65 
 
 
224 aa  79  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  40.98 
 
 
225 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  38.64 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  42.16 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  24.19 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.87 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  42.16 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  42.16 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  37.5 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  42.16 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  37.93 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  36.64 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  25.52 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  31.43 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  25 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  37.07 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  24.87 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  37.07 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  26.94 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  44.19 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  38.46 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  26.29 
 
 
231 aa  72  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  26.29 
 
 
230 aa  72  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.2 
 
 
231 aa  72  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  24.34 
 
 
224 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.87 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  25.77 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  28.12 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  23.81 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  42.53 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  25.77 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  43.9 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.48 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  29.14 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  25.89 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  38.38 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  30.32 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  38.46 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.94 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  33.98 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.49 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  36.11 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  39.02 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  39.02 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  39.02 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  41.46 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  29.86 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.03 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.91 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  35.35 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  30.19 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  30.19 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.48 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  35.96 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  34.31 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  29.57 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  34.52 
 
 
225 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  33.07 
 
 
300 aa  64.7  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.9 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  39.76 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  35.6 
 
 
226 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  28.28 
 
 
255 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.81 
 
 
248 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  26.45 
 
 
233 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.2 
 
 
248 aa  62.8  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  26.45 
 
 
233 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.57 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  25.95 
 
 
222 aa  62.4  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  29.56 
 
 
236 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  28.43 
 
 
231 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.57 
 
 
268 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  35.09 
 
 
217 aa  62  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  34.91 
 
 
233 aa  62.4  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  45.74 
 
 
236 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.93 
 
 
236 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  35.45 
 
 
247 aa  61.6  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  32.26 
 
 
221 aa  61.6  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  29.56 
 
 
236 aa  61.6  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>