More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1175 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  100 
 
 		 241 aa  494  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  48.53 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  40.65 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.65 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  41.28 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  38.16 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0472  HAD family hydrolase  38.68 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.523945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  35.81 
 
 		 231 aa  141  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  31.31 
 
 		 211 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  30.57 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  25.11 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  29.91 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  32.58 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  27.63 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  24.78 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  28.91 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  27.48 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  32.58 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  32.58 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  29.07 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  24.78 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  32.58 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  28.19 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  32.58 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  32.58 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  32.58 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  26.99 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.11 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  26.2 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.13 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  32.58 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  26.51 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  26.51 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  29.15 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  31.82 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  29.15 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.81 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  28.69 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  24.23 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  20.28 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.48 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  29.77 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  36.81 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  30.99 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  27.6 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  23.93 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 		 248 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  29.88 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  25.58 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.12 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  28.76 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  26.41 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  26.07 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  26.58 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  26.58 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  28.07 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  28.1 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  24.79 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.26 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  24.79 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  24.79 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  26.58 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  29.25 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  31.01 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  29.46 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  28.07 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.5 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  27.68 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  34.33 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  27.68 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.24 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  28.23 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  25.69 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  27.65 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  28.07 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  23.56 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  26.64 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.83 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  28.26 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  32.56 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  27.73 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  31.47 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  26.03 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  24.79 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  24.79 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  24.79 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>