More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5662 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
349 aa  679    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0639  HAD family hydrolase  52.63 
 
 
239 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0512419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4700  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.96 
 
 
233 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.63 
 
 
228 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  36.73 
 
 
227 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  26.67 
 
 
231 aa  90.5  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3254  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.92 
 
 
237 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.15 
 
 
225 aa  89.4  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  29.47 
 
 
225 aa  86.7  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  27.05 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0589  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.96 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  26.57 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  26.44 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  29.06 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  32.26 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.33 
 
 
224 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  32.26 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  24.38 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  32.26 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3819  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.75 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  24.61 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  36.26 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  36.96 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.17 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  26.04 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  32.26 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0754  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.27 
 
 
223 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  31.11 
 
 
232 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  29.72 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  30.47 
 
 
258 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  31.03 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  33.71 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  32.34 
 
 
234 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
220 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  32.54 
 
 
217 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1992  hydrolase  26.15 
 
 
254 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.360933  decreased coverage  0.00169391 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.35 
 
 
235 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.35 
 
 
231 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  29 
 
 
228 aa  64.3  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 
225 aa  63.9  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.14 
 
 
222 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.64 
 
 
242 aa  63.2  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.899574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.47 
 
 
250 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  37.14 
 
 
223 aa  62.8  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.99 
 
 
223 aa  62.8  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  34.45 
 
 
226 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  25.25 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0922  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.57 
 
 
219 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  28.74 
 
 
256 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  24.62 
 
 
231 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.08 
 
 
222 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.03 
 
 
222 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.19 
 
 
296 aa  61.2  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  26.91 
 
 
241 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  28.85 
 
 
225 aa  60.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.48 
 
 
260 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  35.86 
 
 
227 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.25 
 
 
244 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.09 
 
 
230 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  30.52 
 
 
208 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  30.17 
 
 
227 aa  60.1  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.52 
 
 
248 aa  60.1  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  28.19 
 
 
225 aa  60.1  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 
230 aa  60.1  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  34.65 
 
 
234 aa  59.7  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  25.33 
 
 
247 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.98 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.845236  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0765  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.77 
 
 
236 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.46 
 
 
242 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.7 
 
 
222 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2555  HAD family hydrolase  46.05 
 
 
260 aa  59.3  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0682224  normal  0.0129404 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  28.43 
 
 
224 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
226 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.88 
 
 
217 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  39.22 
 
 
213 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  31.45 
 
 
221 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  34.31 
 
 
245 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  34.31 
 
 
245 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  29.74 
 
 
255 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  34.27 
 
 
228 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  34.31 
 
 
226 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  34.65 
 
 
227 aa  57  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  34.26 
 
 
233 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.43 
 
 
239 aa  57  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  26.83 
 
 
243 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.95 
 
 
230 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  37.89 
 
 
231 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  34.31 
 
 
245 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  32.38 
 
 
238 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  27.8 
 
 
229 aa  57  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.19 
 
 
219 aa  56.6  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  32.38 
 
 
238 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  42.17 
 
 
235 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  36 
 
 
245 aa  56.6  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  36.22 
 
 
243 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  27.19 
 
 
214 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
233 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>