221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4700 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4700  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 233 aa  431  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0639  HAD family hydrolase  52.43 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0512419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  48.42 
 
 		 349 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3254  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.13 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  31.47 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3819  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.87 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.22 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0589  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.87 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  26.39 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0754  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.44 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  25.57 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.5 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  37.58 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0765  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.5 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  24.26 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.98 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  33 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  34.32 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.03 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  28.12 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.72 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  31.22 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  23.58 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  25.26 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  31.3 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  25.19 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  25.19 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1342  hypothetical protein  28.78 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.971898  normal  0.0399312 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  29.22 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  31.91 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  28.28 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  24.23 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.89 
 
 		 300 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0642685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 		 229 aa  51.6  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.56 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  24.37 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  31.43 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2648  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.89 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.364708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  21.76 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  31.3 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  31.43 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  27.72 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  28.07 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.38 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  25.54 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  31.3 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.78 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  39 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  29.91 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1992  hydrolase  24.69 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.360933  decreased coverage  0.00169391 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  38.69 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  21.09 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  32.97 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  24.35 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  32.88 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  28.86 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  22.66 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  27.68 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  29.52 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.17 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  23.48 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  30.77 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  22.66 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  30.09 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  29.86 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  25.79 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  34.78 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  30.35 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1417  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.84 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49722e-26 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4500  hypothetical protein  30.54 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.73 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  25.6 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  38.94 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  26 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04348  phosphoglycolate phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00760)  31.25 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161139  normal  0.520763 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  19.37 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  21.01 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.55 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.66 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  29.29 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  35.4 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  28.63 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2555  HAD family hydrolase  29.85 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0682224  normal  0.0129404 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2974  hydrolase  35.34 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  26.85 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0147  Fis family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.809381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  27.19 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.98 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  30.62 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>