203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3972 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
220 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  58.41 
 
 
224 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  54.42 
 
 
218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6763  HAD family hydrolase  57.35 
 
 
216 aa  231  9e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  55.56 
 
 
219 aa  231  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  53.49 
 
 
219 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0310  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  52.78 
 
 
222 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1941  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  55.08 
 
 
230 aa  210  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139802  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2155  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  49.33 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  49.3 
 
 
219 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  50.79 
 
 
215 aa  188  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  46.23 
 
 
216 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0396  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.7 
 
 
223 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  47.91 
 
 
217 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  45.7 
 
 
222 aa  160  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3204  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  48.13 
 
 
215 aa  142  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  34.55 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  34.55 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  32.71 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  34.91 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.16 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  33.64 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  31.68 
 
 
234 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  32.67 
 
 
234 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  31.68 
 
 
234 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.92 
 
 
274 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00240  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.33 
 
 
237 aa  55.5  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.89 
 
 
222 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  29.69 
 
 
239 aa  55.5  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  29.69 
 
 
239 aa  55.5  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  34.56 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  28.97 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  28.97 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  40.43 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  28.77 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1666  HAD family hydrolase  41.56 
 
 
259 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  31.73 
 
 
218 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  30.84 
 
 
234 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
241 aa  52  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  27.27 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  31.31 
 
 
221 aa  50.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  29 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.48 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_7222  predicted protein  33.68 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.74166  normal  0.591423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.68 
 
 
228 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  29.7 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  26.45 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  26.61 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  29.2 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0142  HAD family hydrolase  25.3 
 
 
254 aa  49.7  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.28 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  32.67 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.88 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  32.69 
 
 
217 aa  48.9  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  34.09 
 
 
227 aa  48.9  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.39 
 
 
263 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.13 
 
 
240 aa  48.9  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21780  predicted HAD superfamily hydrolase  42.35 
 
 
244 aa  48.9  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000727615  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  42.37 
 
 
259 aa  48.9  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  42.42 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1946  hypothetical protein  42.86 
 
 
70 aa  48.5  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.185313  normal  0.213914 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  25 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0025  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.2 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.69 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  21.76 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  44.83 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  50 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  29.55 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.83 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  21.76 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  20.4 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  26.67 
 
 
128 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  35.56 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1444  HAD superfamily hydrolase  31.73 
 
 
199 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000160322  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1330  HAD family hydrolase  32.08 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2555  HAD family hydrolase  37 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0682224  normal  0.0129404 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  21.95 
 
 
223 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.05 
 
 
250 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  21.39 
 
 
224 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.09 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.47 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0384  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.24 
 
 
226 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000618634  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  30.1 
 
 
300 aa  46.6  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  27.82 
 
 
233 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2941  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  34.51 
 
 
265 aa  46.2  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.608809 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  36.36 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  39.29 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.27 
 
 
259 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.91 
 
 
238 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  32.1 
 
 
264 aa  45.8  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.23 
 
 
230 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  35.29 
 
 
226 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.48 
 
 
248 aa  45.4  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  30.17 
 
 
217 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2949  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.53 
 
 
217 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100254  normal  0.0105539 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  29.81 
 
 
224 aa  45.4  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 
227 aa  45.1  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3064  hydrolase  33.73 
 
 
259 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.852724  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  32.09 
 
 
225 aa  45.1  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>