242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6883 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
219 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  74.16 
 
 
217 aa  298  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  61.68 
 
 
216 aa  261  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3204  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  65.35 
 
 
215 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0396  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  57.28 
 
 
223 aa  221  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  50.68 
 
 
215 aa  195  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  47.85 
 
 
218 aa  192  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  49.3 
 
 
220 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2155  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  49.78 
 
 
235 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1941  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  50.24 
 
 
230 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139802  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0310  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  52.55 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  52.13 
 
 
219 aa  181  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  48.11 
 
 
224 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6763  HAD family hydrolase  52.66 
 
 
216 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  48.08 
 
 
219 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  45.75 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  31.85 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  35.11 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  29.46 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  33.77 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  32.64 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  30.38 
 
 
238 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  34.35 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  34.35 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  34.35 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  34.35 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  34.35 
 
 
242 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  34.35 
 
 
245 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  34.35 
 
 
245 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  30.38 
 
 
238 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  30.86 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  29.94 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  35.79 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  34.07 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  31.29 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  31.33 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  29.29 
 
 
231 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.13 
 
 
250 aa  56.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  30.69 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  29.91 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  27.36 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  28.48 
 
 
227 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  33.13 
 
 
246 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  34.09 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  30.36 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.31 
 
 
268 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  35.19 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  30.82 
 
 
254 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.86 
 
 
263 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01740  hypothetical protein  30 
 
 
255 aa  52  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  30.2 
 
 
235 aa  52  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  28.24 
 
 
239 aa  51.6  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  28.24 
 
 
239 aa  51.6  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  31.11 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  29.63 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  31.29 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  36.09 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  28.07 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  30.82 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.74 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  30.82 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1946  hypothetical protein  48.33 
 
 
70 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.185313  normal  0.213914 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2941  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  41.49 
 
 
265 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.608809 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  33.07 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  31.29 
 
 
251 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  30.15 
 
 
250 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.79 
 
 
259 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  27.72 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  33.09 
 
 
254 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  42.67 
 
 
274 aa  49.3  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  28.16 
 
 
240 aa  49.3  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  29.33 
 
 
262 aa  49.3  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  31.5 
 
 
228 aa  48.9  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  30.54 
 
 
223 aa  48.9  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  32.56 
 
 
225 aa  48.5  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
226 aa  48.9  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  35.48 
 
 
242 aa  48.5  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  21.52 
 
 
224 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  27.47 
 
 
239 aa  48.5  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  41.94 
 
 
243 aa  48.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  30.14 
 
 
256 aa  48.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  37.04 
 
 
229 aa  48.5  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  26.98 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21780  predicted HAD superfamily hydrolase  35.29 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000727615  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  33.83 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.51 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  32.59 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.72 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2221  HAD family hydrolase  37.33 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1594  HAD family hydrolase  31.98 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  31.73 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>