126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6763 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6763  HAD family hydrolase  100 
 
 
216 aa  428  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  83.33 
 
 
218 aa  349  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  76.7 
 
 
219 aa  317  7.999999999999999e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  76.21 
 
 
224 aa  317  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  75.83 
 
 
219 aa  313  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0310  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  67.8 
 
 
222 aa  268  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1941  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  63.78 
 
 
230 aa  245  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139802  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  57.35 
 
 
220 aa  231  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2155  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  54.38 
 
 
235 aa  213  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  57.37 
 
 
215 aa  211  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  55.32 
 
 
217 aa  191  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  51.21 
 
 
216 aa  185  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  52.66 
 
 
219 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0396  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.94 
 
 
223 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  48.65 
 
 
222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3204  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  48.4 
 
 
215 aa  139  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  34.13 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  32.54 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  30.95 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  22.71 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.43 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  21.74 
 
 
224 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  21.74 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  22.22 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  22.22 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  21.74 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  21.26 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  22.04 
 
 
224 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  31.73 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  31.73 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_7222  predicted protein  38.46 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.74166  normal  0.591423 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  24.84 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  29.7 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  23.27 
 
 
225 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  30.69 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
237 aa  55.1  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  39.8 
 
 
247 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  30.48 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  27.72 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  27.72 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21780  predicted HAD superfamily hydrolase  43.53 
 
 
244 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000727615  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  28.87 
 
 
222 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  29.36 
 
 
128 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  34.31 
 
 
225 aa  51.6  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0846  HAD family hydrolase  44.23 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578477  normal  0.241059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0990  HAD family hydrolase  44.23 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.383042  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.35 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  40 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1946  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.185313  normal  0.213914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  39.6 
 
 
239 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  26.47 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  32.04 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
235 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  25.67 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  26.73 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  37.39 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.01 
 
 
234 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  30.1 
 
 
235 aa  48.9  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00363  putative hydrolase phosphatase protein  29.05 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0200608  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  27.08 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  29.7 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0796  HAD family hydrolase  27.94 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  29.03 
 
 
258 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0283  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  39.53 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.04 
 
 
228 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.11 
 
 
259 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  30 
 
 
292 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  24.86 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  24.27 
 
 
233 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.71 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  24.27 
 
 
233 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0142  HAD family hydrolase  42 
 
 
254 aa  45.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  28.85 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.89 
 
 
254 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3521  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
234 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  24.04 
 
 
233 aa  45.4  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.23 
 
 
225 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  26.17 
 
 
239 aa  45.4  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  27.59 
 
 
211 aa  45.1  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0043  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  33.33 
 
 
263 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.58574  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0262  HAD family phosphatase  31.07 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.161792  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  24.86 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  24.86 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  27.96 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  24.75 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  37.23 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1620  HAD family hydrolase  40.38 
 
 
255 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00220504  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2941  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  33 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.608809 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0589  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.15 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  25.54 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0281  HAD family hydrolase  46.15 
 
 
258 aa  43.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  27.42 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  27.42 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  27.42 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  27.42 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.94 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.08 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  34.25 
 
 
255 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  23.78 
 
 
199 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>