130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3651 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 219 aa  438  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  75.46 
 
 		 218 aa  336  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6763  HAD family hydrolase  75.83 
 
 		 216 aa  313  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  72.43 
 
 		 224 aa  311  5.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  72.69 
 
 		 219 aa  304  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0310  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  66.36 
 
 		 222 aa  281  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1941  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  56.88 
 
 		 230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139802  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  53.49 
 
 		 220 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2155  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  55.5 
 
 		 235 aa  222  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  52.36 
 
 		 215 aa  214  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  49.28 
 
 		 216 aa  188  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  50 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0396  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  46.61 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  48.08 
 
 		 219 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  45.36 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3204  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.67 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.12 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  31.86 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  30.47 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  29.69 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  32.69 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  27.82 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  30.91 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  30.93 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  30.93 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  21.46 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  23.29 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  30.71 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.26 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  21.92 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.31 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  23.29 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0384  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.41 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000618634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  22.83 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1946  hypothetical protein  49.15 
 
 		 70 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.185313  normal  0.213914 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  27.88 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  22.04 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  26.73 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  31.67 
 
 		 128 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  24.79 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 235 aa  51.6  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_7222  predicted protein  36.26 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.74166  normal  0.591423 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  20.55 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  38.53 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  38.53 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  26.47 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  28.71 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  39.02 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.44 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  28.66 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  23.92 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1620  HAD family hydrolase  28.68 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00220504  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1176  HAD family hydrolase  37.88 
 
 		 337 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00246579  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1592  HAD family hydrolase  50 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0043  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  37.93 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.58574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.43 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.07 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0142  HAD family hydrolase  36.14 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  29.5 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  28.87 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  32.69 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  30.48 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  30.48 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  30.54 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 231 aa  45.4  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  36.11 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  30.56 
 
 		 223 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.63 
 
 		 248 aa  45.1  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.47 
 
 		 268 aa  45.1  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.57 
 
 		 235 aa  45.1  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.13 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3426  hypothetical protein  27.62 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.045465 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.48 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  37.23 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  32.59 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.05 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1973  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.45 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  35.58 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  28.82 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  28.82 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01740  hypothetical protein  28.17 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  25.38 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  26.37 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.45 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2941  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  34 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.608809 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1142  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  27.62 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  34.58 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.22 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  24.38 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.13 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.98 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.34 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3254  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.89 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.7 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  27.48 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0495  hydrolase  34.91 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>