142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3426 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3426  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  434  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.045465 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  36.36 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.08 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.86 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  34.45 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.14 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  32.8 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  26.19 
 
 
228 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  26.09 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  26.71 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.89 
 
 
237 aa  59.7  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1511  HAD family hydrolase  29.55 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  23.53 
 
 
234 aa  58.2  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.77 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.06 
 
 
215 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  25.42 
 
 
231 aa  56.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  32 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.31 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1167  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.55 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.82 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  23.45 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.83 
 
 
260 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  25.52 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.58 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  32.56 
 
 
230 aa  49.7  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  27.68 
 
 
240 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.66 
 
 
244 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  25.95 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  29.13 
 
 
235 aa  48.9  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41148  predicted protein  21.97 
 
 
317 aa  48.9  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.107357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.71 
 
 
291 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  27.68 
 
 
240 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  33.64 
 
 
231 aa  48.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  33.64 
 
 
231 aa  48.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.35 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  31.68 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  27.83 
 
 
251 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  27.56 
 
 
237 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.48 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  31.82 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.34 
 
 
212 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  28.35 
 
 
230 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  26.36 
 
 
245 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  28.66 
 
 
229 aa  47  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.07 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.18 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  33.71 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  24.32 
 
 
259 aa  46.2  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.81 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
230 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  32.22 
 
 
238 aa  46.2  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  28.48 
 
 
208 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02292  hydrolase  37.84 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.48 
 
 
248 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  25.45 
 
 
217 aa  45.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.28 
 
 
268 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  25.47 
 
 
233 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  32.05 
 
 
234 aa  45.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  31.87 
 
 
225 aa  45.1  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  25 
 
 
222 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  32.05 
 
 
225 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  31.87 
 
 
225 aa  45.1  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  25.47 
 
 
233 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.43 
 
 
227 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.64 
 
 
229 aa  45.1  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  32.63 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.63 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  27.59 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  32.63 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  44.23 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.62 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  26.83 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.39 
 
 
232 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  32.05 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  32.63 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  32.63 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  32.63 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  32.63 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  28.16 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  32.63 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  32.63 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.32 
 
 
223 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  28.79 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.76 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2471  HAD family hydrolase  30 
 
 
171 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0045824  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  23.91 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00240  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.9 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  24.14 
 
 
220 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  29.41 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  29.41 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.33 
 
 
242 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  30.21 
 
 
231 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  25.18 
 
 
233 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.21 
 
 
231 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  29.33 
 
 
257 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.31 
 
 
230 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  26.37 
 
 
229 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>