99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2471 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2471  HAD family hydrolase  100 
 
 		 171 aa  354  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0045824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1902  HAD family hydrolase  57.93 
 
 		 176 aa  196  9e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.94707 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3065  HAD family hydrolase  51.18 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.643413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1615  HAD superfamily hydrolase-like  32.56 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06851  hypothetical protein  32.06 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  27.45 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000876  probable hydrolase  31.01 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  26.28 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  27.61 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  28.47 
 
 		 230 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  31.68 
 
 		 232 aa  50.8  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0281  HAD family hydrolase  38.16 
 
 		 258 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0846  HAD family hydrolase  42.31 
 
 		 260 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578477  normal  0.241059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0990  HAD family hydrolase  42.31 
 
 		 260 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.383042  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  23.85 
 
 		 229 aa  49.7  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.84 
 
 		 235 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  35.11 
 
 		 248 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3064  hydrolase  36.59 
 
 		 259 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.852724  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.15 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.25 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  27.94 
 
 		 230 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.82 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  24.39 
 
 		 230 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  28.35 
 
 		 224 aa  48.5  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 225 aa  48.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  28.24 
 
 		 234 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  23.71 
 
 		 225 aa  47.8  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  24.19 
 
 		 231 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  27.88 
 
 		 224 aa  47.8  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.55 
 
 		 230 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  28.71 
 
 		 234 aa  47.4  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  27.96 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.91 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0384  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.81 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000618634  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  29.09 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.08 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  27.27 
 
 		 255 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  30.56 
 
 		 230 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  30.1 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.45 
 
 		 242 aa  45.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29 
 
 		 228 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  27.27 
 
 		 231 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.34 
 
 		 236 aa  44.7  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.22 
 
 		 263 aa  44.7  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  28.7 
 
 		 224 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  27.27 
 
 		 230 aa  44.3  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  29.55 
 
 		 234 aa  44.3  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  27.27 
 
 		 231 aa  44.3  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  28.12 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  30.15 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  26.92 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  24.03 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  36.84 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.99 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.93 
 
 		 231 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  30.39 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2221  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  33.8 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  23.26 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  30.39 
 
 		 226 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.33 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3426  hypothetical protein  30 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.045465 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  32.35 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.09 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  27.27 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  35.21 
 
 		 259 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  31.37 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  31.37 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  31 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2928  HAD family hydrolase  31.52 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  30.39 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  30.39 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  30.39 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  29.55 
 
 		 234 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  31.4 
 
 		 241 aa  42.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.59 
 
 		 229 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  26.92 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  29.17 
 
 		 231 aa  42.4  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  27.36 
 
 		 233 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  36.14 
 
 		 264 aa  42  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2525  HAD family hydrolase  31.11 
 
 		 245 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  21.77 
 
 		 228 aa  41.6  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  32.14 
 
 		 239 aa  41.6  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.11 
 
 		 248 aa  41.6  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.77 
 
 		 222 aa  41.6  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.45 
 
 		 232 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 		 231 aa  41.6  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.62 
 
 		 225 aa  41.2  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  27.35 
 
 		 252 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 235 aa  41.2  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  26.27 
 
 		 240 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2811  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.06 
 
 		 233 aa  41.2  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1741  HAD superfamily hydrolase  34.85 
 
 		 178 aa  40.8  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.985447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  30.39 
 
 		 238 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  27.21 
 
 		 231 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>