More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2832 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  100 
 
 		 248 aa  495  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2297  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  30.66 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.0190476 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  32 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0159  hydrolase  25.79 
 
 		 259 aa  72  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.971572  normal  0.683122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1054  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.02 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  28.76 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  27.87 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.09 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  30.21 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  36.19 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1937  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.57 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.612743  normal  0.0123866 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  30.6 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1233  hydrolase  30.26 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  35.48 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1902  HAD family hydrolase  35.85 
 
 		 176 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.94707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  29.96 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.17 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  31.54 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  22.94 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  31.23 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  33.87 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  35.78 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  29.55 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  32.79 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  33.87 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  34.71 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1773  hydrolase  28.11 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.672363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  33.33 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  35.78 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  33.33 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  33.06 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  33.33 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.03 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  23.11 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  26.43 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  38.18 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  36.8 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2941  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  37.86 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.608809 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  29.61 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  29.61 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  36.8 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  46.55 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  36.8 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  32.79 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  46.55 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.76 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  36.54 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  37.61 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  27.27 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  22.82 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  30.48 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1167  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.23 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  28.4 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  28.4 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  32.5 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  28.95 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.95 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  35.51 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  30.59 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  25.81 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  28.95 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.61 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  30.59 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  28.95 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  35.51 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0352  HAD family hydrolase  23.43 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.584229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.65 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  44.83 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  28.95 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  29.76 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  31.97 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  25 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  27.1 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  28.79 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  30.1 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  27.27 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  27.5 
 
 		 224 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  34.62 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  29.41 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.42 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.64 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.89 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  30.88 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  31.67 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  31.03 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  35.42 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  26.15 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  26.15 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  32.26 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  34 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  27.06 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  26.15 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  26.15 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1323  HAD family hydrolase  25.91 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00954891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.03 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>