269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1233 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1233  hydrolase  100 
 
 
237 aa  454  1e-127  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0159  hydrolase  40 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.971572  normal  0.683122 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0352  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.584229  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1323  HAD family hydrolase  32.08 
 
 
269 aa  85.9  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00954891  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1773  hydrolase  31.12 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.672363 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1153  HAD family hydrolase  28.4 
 
 
252 aa  79  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.94325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  31.92 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  42.86 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  32 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  30.2 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  35.34 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1167  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.45 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  35.05 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  28.87 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  38.3 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.07 
 
 
219 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  31.76 
 
 
266 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.98 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  30.6 
 
 
234 aa  58.9  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  30.67 
 
 
232 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  35.79 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1937  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.23 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.612743  normal  0.0123866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  35.79 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  34.74 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  33.59 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  34.74 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  34.74 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  32.03 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  34.74 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  35.34 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  26.58 
 
 
258 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1054  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.84 
 
 
244 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  30.4 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  30.66 
 
 
225 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  30.66 
 
 
225 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  33.67 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  33.67 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  30.47 
 
 
241 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  32.11 
 
 
209 aa  55.1  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.16 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  39.71 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  28.89 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  27.03 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  33.67 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  40.54 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  34.75 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  29.6 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  30.36 
 
 
230 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
221 aa  53.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  37.38 
 
 
228 aa  53.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  39.71 
 
 
245 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  29.81 
 
 
224 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  38.24 
 
 
245 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  32.05 
 
 
234 aa  52.4  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41148  predicted protein  27.31 
 
 
317 aa  52.4  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.107357 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  30.47 
 
 
224 aa  52  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  44.12 
 
 
239 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  38.24 
 
 
245 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 
226 aa  52  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  29.7 
 
 
272 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_7222  predicted protein  32 
 
 
205 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.74166  normal  0.591423 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  29.91 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  29.7 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  29.18 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  38.24 
 
 
226 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.39 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  36.94 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  30.2 
 
 
272 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  33.91 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.37 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  31.3 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  32.04 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  32.08 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  30.85 
 
 
225 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2297  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  25.7 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.0190476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  31.08 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  29.93 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  32.63 
 
 
225 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  32.63 
 
 
225 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  30.85 
 
 
225 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  30.85 
 
 
225 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  30.85 
 
 
225 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  30.85 
 
 
225 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  20.17 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  32.63 
 
 
225 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  32.89 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.51 
 
 
263 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  26.32 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  31.78 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  30.37 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.26 
 
 
583 aa  49.3  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  33.03 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  35 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 
228 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  28.78 
 
 
227 aa  49.3  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>