82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1153 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1153  HAD family hydrolase  100 
 
 		 252 aa  507  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.94325 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0352  HAD family hydrolase  76.21 
 
 		 250 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.584229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1323  HAD family hydrolase  75 
 
 		 269 aa  397  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00954891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1773  hydrolase  74.4 
 
 		 251 aa  397  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.672363 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0159  hydrolase  33.2 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.971572  normal  0.683122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1167  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.77 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1233  hydrolase  26.8 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  29.15 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  30.48 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.04 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  23.91 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  26.79 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.94 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.09 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.67 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.51 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  34.91 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.94 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  33.65 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  32.41 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.74 
 
 		 583 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  25.34 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  31.07 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  29.36 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1937  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.33 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.612743  normal  0.0123866 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.66 
 
 		 217 aa  49.3  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.86 
 
 		 212 aa  48.9  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  27.52 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  30.14 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  24.4 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1511  HAD family hydrolase  32.41 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_7222  predicted protein  34.65 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.74166  normal  0.591423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3196  HAD family hydrolase  31.11 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.19 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00240  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.89 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  32.11 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  34 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  31.31 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  40.79 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  26.79 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41148  predicted protein  27.73 
 
 		 317 aa  45.8  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.107357 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.66 
 
 		 229 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.38 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0133  HAD family hydrolase  32 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  27.88 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  34 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  30.51 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  29.29 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  29.35 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  30.51 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  24.19 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 218 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  29.35 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1176  HAD family hydrolase  28.46 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00246579  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  30.43 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.68 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.02 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.29 
 
 		 219 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  35.62 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  33.7 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4905  hydrolase  30.39 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  29.35 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15870  predicted protein  29.41 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296862  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  25 
 
 		 229 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  26.73 
 
 		 231 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.82 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  27.96 
 
 		 226 aa  42.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  33.7 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  30.77 
 
 		 215 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 222 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.94 
 
 		 232 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0129  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.84 
 
 		 543 aa  42  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.07 
 
 		 231 aa  42  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.43 
 
 		 239 aa  42  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>