158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3196 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3196  HAD family hydrolase  100 
 
 		 237 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  51.72 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  48.05 
 
 		 243 aa  190  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1176  HAD family hydrolase  37.67 
 
 		 337 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00246579  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  29.96 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  32.06 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  40.7 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35120  haloacid dehalogenase superfamily protein  30.3 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  31.2 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.53 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  31.31 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  29.02 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  26.89 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0129  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.04 
 
 		 543 aa  55.8  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  28.89 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  30.09 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  25.98 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.5 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.4 
 
 		 263 aa  52.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  38.61 
 
 		 583 aa  52.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  29.5 
 
 		 231 aa  52  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.63 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  33.58 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.14 
 
 		 349 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0922  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.5 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  27.39 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  29.1 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  28.81 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1937  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.42 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.612743  normal  0.0123866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  28.69 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.92 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.25 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.86 
 
 		 268 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  31.25 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  32.67 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.89 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0765  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.58 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1323  HAD family hydrolase  34.41 
 
 		 269 aa  48.9  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00954891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3261  phosphonoacetaldehyde hydrolase  29.36 
 
 		 275 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258798  normal  0.0791037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  29 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  26.47 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.7 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  26.47 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  31.52 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 230 aa  48.5  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  42.86 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0796  HAD family hydrolase  35.92 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0352  HAD family hydrolase  31.11 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.584229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1153  HAD family hydrolase  31.11 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.94325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.44 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  22.44 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.83 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  30.85 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3819  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.46 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  29.54 
 
 		 986 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.75 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.76 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0159  hydrolase  34.38 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.971572  normal  0.683122 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.24 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.17 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.8 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1444  HAD superfamily hydrolase  28.43 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000160322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3684  phosphonoacetaldehyde hydrolase  26.73 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  21.74 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3360  HAD family hydrolase  25 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000863998  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2294  HAD superfamily hydrolase  34.74 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.31 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.18 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  31.3 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.92 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  25.88 
 
 		 225 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.29 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  23.65 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  27.59 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  25.26 
 
 		 230 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  25.24 
 
 		 224 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.82 
 
 		 216 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  25.19 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1773  hydrolase  35.16 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.672363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  25.71 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.41 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0713  hypothetical protein  29.41 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.32 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  29.69 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  32.18 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2533  HAD family phosphatase  29.47 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.48 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0133  HAD family hydrolase  33.66 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  24.88 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  25.63 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.85 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>