274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0713 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0713  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  511  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1984  haloacid dehalogenase-like hydrolase  85.64 
 
 
181 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.911586  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2949  haloacid dehalogenase-like hydrolase  56.02 
 
 
217 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100254  normal  0.0105539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0712  haloacid dehalogenase-like hydrolase  56.02 
 
 
217 aa  250  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.903699  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2188  HAD family hydrolase  48.84 
 
 
220 aa  228  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.44 
 
 
242 aa  122  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  33.66 
 
 
235 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.81 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  32.73 
 
 
208 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  27.49 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  26.61 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  28.11 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  25.6 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  34.62 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  33.64 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  36.54 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  35.58 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  25.84 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
231 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.88 
 
 
217 aa  58.5  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.09 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  25.57 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  32.71 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  27.13 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  27.65 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  28.84 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.36 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  26.61 
 
 
234 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  30.69 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  26.91 
 
 
234 aa  55.8  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  24.88 
 
 
235 aa  55.8  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  25 
 
 
231 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  21.56 
 
 
224 aa  55.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
243 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  24.17 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  24.17 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  27.64 
 
 
224 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  27.64 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.32 
 
 
222 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  29.9 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.9 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  29.9 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0945  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.14 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  29.9 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  29.9 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  29.9 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2038  HAD superfamily hydrolase  36.73 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  29.9 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  33.75 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  29.9 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  29.9 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  29.9 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  29.9 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  29.36 
 
 
227 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  29.9 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  25.52 
 
 
224 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  29.9 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  34.86 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.83 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  32.95 
 
 
238 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  30.86 
 
 
211 aa  53.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  32.58 
 
 
228 aa  53.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2928  HAD family hydrolase  39.68 
 
 
230 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244628  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  29.9 
 
 
225 aa  52.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  32.95 
 
 
238 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  33.72 
 
 
231 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  24.8 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  34.48 
 
 
300 aa  51.2  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  28.22 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.39 
 
 
212 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.69 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3521  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.58 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.92 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  32.56 
 
 
230 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  27.69 
 
 
231 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  39.68 
 
 
234 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  20.63 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.62 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.23 
 
 
193 aa  50.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.71 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  35 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  26.21 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2297  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  25.35 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.0190476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  33.75 
 
 
233 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  24.43 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  25.7 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2746  HAD family hydrolase  27.19 
 
 
226 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.20923  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.67 
 
 
214 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  26.19 
 
 
242 aa  49.7  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  29.73 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.56 
 
 
230 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.09 
 
 
206 aa  49.3  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  29.35 
 
 
228 aa  49.3  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  38.1 
 
 
233 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01012  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12880)  23.87 
 
 
261 aa  48.9  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>