209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0712 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0712  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 
217 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.903699  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2949  haloacid dehalogenase-like hydrolase  96.31 
 
 
217 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100254  normal  0.0105539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0713  hypothetical protein  56.02 
 
 
248 aa  250  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2188  HAD family hydrolase  46.89 
 
 
220 aa  201  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1984  haloacid dehalogenase-like hydrolase  53.71 
 
 
181 aa  191  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.911586  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.47 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.58 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
235 aa  89.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  31.58 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  31.73 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  26.39 
 
 
228 aa  58.5  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.93 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.87 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  27.4 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2746  HAD family hydrolase  27.59 
 
 
226 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.20923  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  29.73 
 
 
231 aa  55.1  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  24.64 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0628  HAD family hydrolase  35.24 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  26.21 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  26.21 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  25.35 
 
 
258 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  27.45 
 
 
234 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  30.48 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  27.14 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.57 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2297  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  29.56 
 
 
248 aa  52.4  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.0190476 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  32.08 
 
 
234 aa  52.4  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  23.98 
 
 
229 aa  52.4  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  32.53 
 
 
223 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.71 
 
 
239 aa  51.6  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  26.76 
 
 
232 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  31.87 
 
 
224 aa  51.6  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  31.63 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  26.67 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.36 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  30.77 
 
 
128 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  31.96 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  30.33 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  23.89 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3591  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.43 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716122  hitchhiker  0.00156423 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  30.86 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.77 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  30.86 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.88 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  31.96 
 
 
249 aa  49.7  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25290  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  24.73 
 
 
244 aa  48.9  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0218735  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.45 
 
 
250 aa  48.9  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  29.46 
 
 
245 aa  48.5  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  25.11 
 
 
230 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  26.51 
 
 
232 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  29.67 
 
 
224 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  30.15 
 
 
231 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0639  HAD family hydrolase  30.69 
 
 
239 aa  48.5  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0512419 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
239 aa  48.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
239 aa  48.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.71 
 
 
234 aa  48.5  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.1 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  31.91 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  29.91 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  29.79 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  28.83 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  25.35 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.46 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.74 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  22.54 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  27.82 
 
 
300 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  24.65 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.73 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.18 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  30.19 
 
 
232 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.17 
 
 
218 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.91 
 
 
236 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.29 
 
 
217 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.88 
 
 
232 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  38.71 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  37.1 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 
251 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  29.79 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.77 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  26.32 
 
 
241 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  26.45 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  26.67 
 
 
237 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  32.35 
 
 
256 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  30 
 
 
231 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  22.01 
 
 
248 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  29.37 
 
 
231 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  24.74 
 
 
227 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  34.38 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  25.69 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.43 
 
 
251 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.03 
 
 
583 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1176  HAD family hydrolase  31.5 
 
 
337 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00246579  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0754  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.78 
 
 
223 aa  45.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0361  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  35.96 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.751245  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.21 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  30.84 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  21.66 
 
 
235 aa  45.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.38 
 
 
230 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  30.77 
 
 
255 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>