243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2188 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2188  HAD family hydrolase  100 
 
 
220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0713  hypothetical protein  48.84 
 
 
248 aa  228  8e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2949  haloacid dehalogenase-like hydrolase  47.17 
 
 
217 aa  203  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100254  normal  0.0105539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0712  haloacid dehalogenase-like hydrolase  46.89 
 
 
217 aa  201  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.903699  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1984  haloacid dehalogenase-like hydrolase  45.25 
 
 
181 aa  168  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.911586  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.94 
 
 
242 aa  105  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  31.53 
 
 
235 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.5 
 
 
248 aa  99  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  28.03 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  26.52 
 
 
223 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  23.62 
 
 
224 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  26.32 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.12 
 
 
224 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
258 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  32.91 
 
 
234 aa  58.2  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  24.81 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  24.06 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  24.06 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  32.93 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  24.06 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.63 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  32.69 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  32.05 
 
 
128 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  27.62 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.83 
 
 
217 aa  55.8  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  24.42 
 
 
234 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  28.4 
 
 
230 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  28.95 
 
 
242 aa  55.1  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  30.85 
 
 
300 aa  55.1  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  29.79 
 
 
300 aa  54.7  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  29.11 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0754  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.92 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  26.47 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  26.11 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  28.4 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  29.07 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.4 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  23.15 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  30.59 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  34.83 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  31.18 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  30.28 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  23.81 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  22.89 
 
 
224 aa  52  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  27.72 
 
 
230 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  34.78 
 
 
212 aa  52  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.16 
 
 
230 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  26.92 
 
 
239 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  26.92 
 
 
239 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15870  predicted protein  34.04 
 
 
282 aa  51.6  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296862  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0025  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.57 
 
 
209 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  26.58 
 
 
231 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  26.58 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  26.58 
 
 
230 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  35.71 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.38 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1878  HAD superfamily hydrolase  35.78 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0128231  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  30.84 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  25.94 
 
 
238 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.85 
 
 
230 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  34.57 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.27 
 
 
260 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.89 
 
 
236 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00240  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.58 
 
 
237 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  26.42 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3521  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.9 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  35.64 
 
 
225 aa  49.7  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  23.88 
 
 
225 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0304  HAD-superfamily hydrolase  38.64 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.61412  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  22.8 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.8 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  22.8 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  22.8 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3254  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.58 
 
 
237 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  26.11 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  22.8 
 
 
225 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.12 
 
 
268 aa  48.9  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  22.8 
 
 
225 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  28.24 
 
 
255 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  34.02 
 
 
233 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  22.8 
 
 
225 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  22.8 
 
 
225 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  27.34 
 
 
203 aa  48.5  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  22.8 
 
 
225 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  22.8 
 
 
225 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  22.8 
 
 
225 aa  48.5  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.74 
 
 
225 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2038  HAD superfamily hydrolase  30.43 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  35.44 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  31.63 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  34.18 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  29.03 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  27.27 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  31.48 
 
 
226 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3819  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.57 
 
 
251 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>