150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1878 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1878  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0128231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3360  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 251 aa  165  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000863998  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  30.04 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.59 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  29.7 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  32.74 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  32.08 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  31.86 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1167  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.95 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2746  HAD family hydrolase  28.68 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.20923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  28.4 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.4 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  24.49 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  25 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  27.81 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  29.5 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  33.01 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  33.01 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  30.22 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  24.49 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  24.89 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  24.69 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  29.79 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.08 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  28.12 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  26.88 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  23.91 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  24.49 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  28.47 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  29.66 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  30.08 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1992  hydrolase  24.28 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.360933  decreased coverage  0.00169391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  23.18 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  23.08 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0025  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.93 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.65 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  23.53 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  23.15 
 
 		 230 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 217 aa  52.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  29.53 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  33.91 
 
 		 228 aa  52.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  27.54 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.08 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.845236  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 		 216 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  31.87 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0737  HAD family hydrolase  29.45 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421268  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  24.14 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0751  HAD family hydrolase  29.45 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2188  HAD family hydrolase  35.78 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0731  HAD family hydrolase  29.45 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  23.35 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  26.9 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  25.85 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  25.66 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.72 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0949  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  26.92 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0023  HAD family hydrolase  29.08 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  25.55 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  31.46 
 
 		 225 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  27.27 
 
 		 224 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  26.9 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  27.4 
 
 		 231 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  28.41 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  26.9 
 
 		 230 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  23.04 
 
 		 233 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.87 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 231 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  39.06 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  23.04 
 
 		 233 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  32.97 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  42.59 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  25.53 
 
 		 245 aa  48.9  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  24.64 
 
 		 235 aa  48.9  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  31.85 
 
 		 228 aa  48.9  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  23.5 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0133  HAD family hydrolase  24.42 
 
 		 231 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.18 
 
 		 238 aa  48.9  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.59 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  29.21 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  27.4 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.77 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  29.84 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.07 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.04 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.26 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  22.22 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  31.63 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0361  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  34.55 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.751245  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  27.17 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  30.26 
 
 		 208 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2637  hypothetical protein  29 
 
 		 813 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1937  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.21 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.612743  normal  0.0123866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  24.57 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  23.91 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  24.57 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>