More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0046 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
216 aa  441  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  53.05 
 
 
217 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.7 
 
 
221 aa  127  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.5 
 
 
250 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.24 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3292  HAD family hydrolase  35.14 
 
 
214 aa  82  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125933 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.11 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.18 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3065  HAD family hydrolase  35.29 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  31.67 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  27.6 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  31.16 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  27.15 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  31.16 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  30.65 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  26.7 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  28.05 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.24 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  30.65 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  27.98 
 
 
224 aa  72  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  27.6 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  28.64 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  28.93 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.35 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  29.77 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  36.67 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  30.65 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  25.34 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  36 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  25 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1992  hydrolase  28.87 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.360933  decreased coverage  0.00169391 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  28.21 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  29.02 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  26.55 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.73 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  30 
 
 
234 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.2 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  34.21 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  24.06 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  30.1 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  26.67 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  30.85 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  30.41 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  23.92 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  23.92 
 
 
230 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  31.39 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.81 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.14 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  24.76 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  27.98 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  33.33 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  29.66 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.51 
 
 
244 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  32.23 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  27.4 
 
 
224 aa  62.8  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  29.24 
 
 
230 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.41 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  24.88 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  30.96 
 
 
219 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  28.86 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  28.79 
 
 
225 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  28.79 
 
 
225 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  28.79 
 
 
225 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  27.98 
 
 
225 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  28.79 
 
 
225 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  28.79 
 
 
225 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.75 
 
 
231 aa  62  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  27.98 
 
 
225 aa  62  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.98 
 
 
225 aa  62  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  27.98 
 
 
225 aa  62  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  27.98 
 
 
225 aa  62  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0085  HAD family hydrolase  25.2 
 
 
241 aa  61.6  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  hitchhiker  0.00000571122 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.53 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  33.96 
 
 
248 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  27.36 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.68 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  27.98 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  27.98 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3521  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.99 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  28.85 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  27.35 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  24.62 
 
 
228 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  31.09 
 
 
128 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.15 
 
 
234 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  31.3 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 
234 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  23.08 
 
 
225 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1799  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  35.77 
 
 
259 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  27.52 
 
 
225 aa  58.9  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.12 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  28.63 
 
 
226 aa  58.5  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  31.4 
 
 
231 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  24.76 
 
 
231 aa  58.5  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  36.48 
 
 
238 aa  58.2  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  31.78 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  23 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  28.11 
 
 
233 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.14 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  27.14 
 
 
239 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  30.43 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>