72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1937 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1937  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 231 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.612743  normal  0.0123866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1167  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.36 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  25.57 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.66 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  35.87 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  23.89 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1323  HAD family hydrolase  23.93 
 
 		 269 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00954891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  24.86 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3360  HAD family hydrolase  37.04 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000863998  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  33.8 
 
 		 237 aa  51.6  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.98 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2297  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  33.72 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.0190476 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  27.12 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  27.12 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0159  hydrolase  25.93 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.971572  normal  0.683122 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  31.91 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3196  HAD family hydrolase  24.42 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.76 
 
 		 583 aa  49.3  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1153  HAD family hydrolase  28.33 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.94325 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.11 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1233  hydrolase  24.4 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0352  HAD family hydrolase  22.81 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.584229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.53 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1773  hydrolase  24.02 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.672363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.95 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1878  HAD superfamily hydrolase  26.21 
 
 		 261 aa  46.2  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0128231  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  31.51 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  28.85 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  26.21 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  36.51 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  37.18 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  27.63 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.78 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.73 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  28.57 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  30.26 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  28.12 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  24.4 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  28.05 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  29.11 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  30.67 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  24.88 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  27.03 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  24.4 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  29.46 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  32 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.31 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  32 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  32 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  36.49 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  28.47 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  29.2 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0129  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.05 
 
 		 543 aa  43.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  29.33 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.35 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  26.32 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.29 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  24.4 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  30.4 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  27.73 
 
 		 231 aa  42  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  23.5 
 
 		 242 aa  42.4  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  27.35 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  27.85 
 
 		 228 aa  42  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  30.16 
 
 		 220 aa  42  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.7 
 
 		 237 aa  42  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  30.56 
 
 		 225 aa  42  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0990  HAD family hydrolase  31.34 
 
 		 260 aa  42  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.383042  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0846  HAD family hydrolase  31.34 
 
 		 260 aa  42  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578477  normal  0.241059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  26.32 
 
 		 230 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>