50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1167 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1167  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 236 aa  490  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1937  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.36 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.612743  normal  0.0123866 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1323  HAD family hydrolase  25.46 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00954891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1153  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.94325 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1773  hydrolase  25.86 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.672363 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0352  HAD family hydrolase  24.89 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.584229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0159  hydrolase  30.23 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.971572  normal  0.683122 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1878  HAD superfamily hydrolase  28.95 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0128231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3360  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000863998  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.9 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3426  hypothetical protein  34.55 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.045465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5571  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  37 
 
 		 254 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1233  hydrolase  24.88 
 
 		 237 aa  52  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.33 
 
 		 583 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0129  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.69 
 
 		 543 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  28.26 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  28.26 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  26.22 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  28.95 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  28.95 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.82 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  30 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  23.53 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.4 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  27.03 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  28.7 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  26.01 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  29.06 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.21 
 
 		 215 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2297  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  25.12 
 
 		 248 aa  45.1  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.0190476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.34 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  25 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  30.19 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  36.11 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  31.19 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.85 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.57 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2255  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  0.797248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0725  HAD superfamily hydrolase-like  35.58 
 
 		 862 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237174  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2637  hypothetical protein  35.58 
 
 		 813 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  25.46 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  28.69 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.6 
 
 		 254 aa  42.4  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.35 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.3 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  27.91 
 
 		 218 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0133  HAD family hydrolase  29.29 
 
 		 231 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0589  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.36 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>