127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0133 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0133  HAD family hydrolase  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.44 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.78 
 
 		 583 aa  59.7  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1992  hydrolase  23.27 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.360933  decreased coverage  0.00169391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  40 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  35.78 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  23.78 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1878  HAD superfamily hydrolase  24.42 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0128231  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  24.44 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.77 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.17 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.66 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  33.68 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  30 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_7222  predicted protein  35.16 
 
 		 205 aa  52  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.74166  normal  0.591423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  32.2 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.28 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  29.66 
 
 		 292 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3360  HAD family hydrolase  31.91 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000863998  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.14 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  23.77 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.25 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  37.4 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  25.41 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  32.41 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  34.48 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.24 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5571  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  36.78 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0023  HAD family hydrolase  36 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  32.77 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0737  HAD family hydrolase  37.37 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0751  HAD family hydrolase  37.37 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0731  HAD family hydrolase  37.37 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0129  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.2 
 
 		 543 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.23 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  33.01 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  28 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  27.17 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  23.77 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  29.47 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3103  HAD family hydrolase  31.31 
 
 		 562 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1511  HAD family hydrolase  27.64 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  38.1 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  29.55 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.23 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  28.42 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  29.47 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.26 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  27.03 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  27.03 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  26.04 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1773  hydrolase  28.49 
 
 		 251 aa  45.4  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.672363 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  35 
 
 		 228 aa  45.4  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1153  HAD family hydrolase  32 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.94325 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  30.61 
 
 		 217 aa  45.1  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.04 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  29.55 
 
 		 128 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  27.33 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3196  HAD family hydrolase  33.66 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92236  predicted protein  26.67 
 
 		 288 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000528701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  32.26 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  28.47 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  32.29 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  28.42 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  28.41 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  28.8 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.3 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.78 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.42 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2949  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.54 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100254  normal  0.0105539 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1054  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.48 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  32.31 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  33.04 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  32.32 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  24.79 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0527  hydrolase  26.71 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.65 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  28.42 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0712  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.81 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.903699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  26.53 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0262  HAD family phosphatase  33.33 
 
 		 166 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.161792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  34.69 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0352  HAD family hydrolase  29.14 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.584229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1323  HAD family hydrolase  28.67 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00954891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1176  HAD family hydrolase  30.56 
 
 		 337 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00246579  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.91 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.91 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.83 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  32.95 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  27.27 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.14 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>