216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4115 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.31 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  25.85 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  26.05 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  26.73 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  26.73 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_7222  predicted protein  26.34 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.74166  normal  0.591423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  26.39 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  23.96 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  28.31 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.29 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.86 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41148  predicted protein  23.01 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.107357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  29.09 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0796  HAD family hydrolase  37.84 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  22.65 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  30.59 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3426  hypothetical protein  26.89 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.045465 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  37.21 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0396  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.23 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  28.47 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  27.48 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  26.35 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  29.22 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  32.82 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  25.97 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  31.01 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  32.28 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  29.92 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.31 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.37 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.53 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.63 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6763  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  28.9 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  34.26 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.35 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.23 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  29.13 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1292  HAD family hydrolase  30.34 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.26 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  34.06 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.33 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.54 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5896  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.56 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  30.57 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4142  hydrolase  34.09 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  31.43 
 
 		 292 aa  52  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  34.26 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  33.33 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0310  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.83 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  34.26 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2255  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  0.797248 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01740  hypothetical protein  32.06 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.69 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  32.45 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  27.39 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  30.4 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2373  HAD family hydrolase  31.43 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.7 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  27.59 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  24.37 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.22 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35120  haloacid dehalogenase superfamily protein  33.59 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1941  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.48 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139802  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.61 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  35.38 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  33.03 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.01 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  28.35 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  24.17 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  24.17 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.12 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  28.35 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  28.35 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  28.35 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  29.92 
 
 		 225 aa  48.9  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  35 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15870  predicted protein  23.24 
 
 		 282 aa  48.5  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296862  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  35.35 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.74 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.845236  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.19 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  31.43 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.94 
 
 		 583 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  26.98 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  28.08 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.91 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  31 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2188  HAD family hydrolase  31.94 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  25.62 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  25.62 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>