112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4142 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4142  hydrolase  100 
 
 
233 aa  464  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.17311 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.03 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.35 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.11 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30 
 
 
583 aa  52.8  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  28.95 
 
 
231 aa  52.8  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  30.19 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  30.19 
 
 
229 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  32.41 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  32.41 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  31.82 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  32.61 
 
 
248 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  27.35 
 
 
227 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.56 
 
 
236 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  32.58 
 
 
226 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  26.5 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  30.46 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  27.87 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  31.82 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  21.76 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  33.91 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  31.82 
 
 
226 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  20.89 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  25.19 
 
 
234 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  26.36 
 
 
255 aa  47  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  28.97 
 
 
225 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  31.58 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.78 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  22.88 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  20.54 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 
225 aa  46.2  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.97 
 
 
234 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.88 
 
 
248 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  32.11 
 
 
260 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  32.11 
 
 
260 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  32.11 
 
 
267 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  32.11 
 
 
267 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  32.11 
 
 
258 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  32.11 
 
 
267 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  32.11 
 
 
267 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  33.07 
 
 
271 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  35.82 
 
 
208 aa  45.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.68 
 
 
222 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1802  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  30.89 
 
 
176 aa  45.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  32.11 
 
 
253 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  25.19 
 
 
234 aa  45.4  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  32.11 
 
 
253 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  25.93 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  29.46 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  28.78 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  26.26 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.78 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  22.68 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1803  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  30.89 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3819  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.77 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  28.49 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  27.48 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  28.84 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  29.81 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  30.28 
 
 
255 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0521  hypothetical protein  23.18 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  30.28 
 
 
255 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  30.28 
 
 
255 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  31.19 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  30.84 
 
 
262 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  31 
 
 
237 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  32.48 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  25.93 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2072  HAD family hydrolase  27.34 
 
 
222 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000098787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.97 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  26.62 
 
 
221 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  29.06 
 
 
227 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  31.19 
 
 
253 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  38.6 
 
 
212 aa  42.7  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.68 
 
 
228 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  28.85 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.97 
 
 
203 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  25.51 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  34.21 
 
 
217 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  30.56 
 
 
237 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
232 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
232 aa  42.4  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
232 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1444  HAD superfamily hydrolase  35.34 
 
 
199 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000160322  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  29.2 
 
 
262 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  26.23 
 
 
241 aa  42.4  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  24.43 
 
 
234 aa  42  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  26.85 
 
 
220 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  23.28 
 
 
239 aa  42  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  29.46 
 
 
233 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  31.3 
 
 
231 aa  42  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  27.96 
 
 
234 aa  42  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  31.5 
 
 
270 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 
251 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1292  HAD family hydrolase  26.76 
 
 
207 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  23.91 
 
 
225 aa  42  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  23.91 
 
 
225 aa  42  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.7 
 
 
206 aa  42  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  25.56 
 
 
194 aa  42  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>