230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1648 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  84.87 
 
 		 271 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  69.53 
 
 		 262 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  71.22 
 
 		 253 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  70.48 
 
 		 255 aa  361  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  70.11 
 
 		 255 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  70.11 
 
 		 255 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  69.37 
 
 		 253 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  69.37 
 
 		 253 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  69 
 
 		 253 aa  351  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  70.16 
 
 		 260 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  67.16 
 
 		 258 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  70.16 
 
 		 267 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  70.16 
 
 		 267 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  70.16 
 
 		 267 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  70.16 
 
 		 267 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  70.16 
 
 		 260 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  61.38 
 
 		 233 aa  298  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1995  haloacid dehalogenase, type II  70.97 
 
 		 251 aa  298  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.018403  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  61.98 
 
 		 232 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  61.98 
 
 		 232 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  60.66 
 
 		 237 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  57.5 
 
 		 233 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  53.11 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  48.78 
 
 		 242 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  51.04 
 
 		 225 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  48.39 
 
 		 236 aa  225  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2046  haloacid dehalogenase, type II  43.78 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3582  haloacid dehalogenase, type II  45.32 
 
 		 255 aa  208  9e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  45.66 
 
 		 249 aa  208  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  44.14 
 
 		 237 aa  198  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  42.67 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  42.67 
 
 		 229 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  42.8 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  39.23 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  42.61 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  43.33 
 
 		 226 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  42.68 
 
 		 226 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  43.51 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  40.99 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  39.64 
 
 		 220 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  40.34 
 
 		 227 aa  151  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  39.35 
 
 		 224 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3296  haloacid dehalogenase, type II  39.35 
 
 		 224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  41.2 
 
 		 229 aa  145  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  40.54 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  41.78 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  39.48 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  39.35 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  38.99 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  39.75 
 
 		 227 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  36.89 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  36.99 
 
 		 229 aa  132  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  33.62 
 
 		 240 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  35.25 
 
 		 228 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  37.86 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  39.11 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  29.24 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  31.15 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02361  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_5G14640)  32.13 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 		 222 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  30.38 
 
 		 228 aa  99.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  29.22 
 
 		 226 aa  99.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  26.34 
 
 		 241 aa  94  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2254  haloacid dehalogenase, type II  28.77 
 
 		 233 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00115148  normal  0.719984 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  30.67 
 
 		 227 aa  92.8  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1673  haloacid dehalogenase, type II  33.18 
 
 		 223 aa  92.4  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  29.66 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  29.71 
 
 		 224 aa  89  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  27.15 
 
 		 230 aa  89  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  28.51 
 
 		 198 aa  87  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  25.82 
 
 		 234 aa  85.5  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  25.82 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  28.14 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  27.49 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  26.75 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  24.69 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  29.24 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  24.05 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  28.74 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  26.53 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  25.23 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  24.32 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  30.25 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  29.18 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  24.88 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.65 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  26.51 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  25.59 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.04 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  26.79 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  27.78 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  27.65 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  27.16 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  27.38 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  25.68 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  26.5 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  24.29 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>