208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1362 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  100 
 
 		 233 aa  480  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  90.48 
 
 		 232 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  90.48 
 
 		 232 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  75.11 
 
 		 233 aa  367  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  75.11 
 
 		 237 aa  359  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  63.68 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  61.38 
 
 		 270 aa  298  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  59.92 
 
 		 271 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  59.65 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  59.65 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  59.21 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  59.21 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  59.21 
 
 		 236 aa  275  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  59.21 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  58.48 
 
 		 239 aa  272  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  57.46 
 
 		 253 aa  269  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  57.46 
 
 		 253 aa  269  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  61.95 
 
 		 260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  56.76 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  61.95 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  61.95 
 
 		 267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  61.95 
 
 		 267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  61.95 
 
 		 267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  61.95 
 
 		 267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  61.95 
 
 		 260 aa  258  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1995  haloacid dehalogenase, type II  62.22 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.018403  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  55.91 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3582  haloacid dehalogenase, type II  52.05 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  53.71 
 
 		 249 aa  234  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2046  haloacid dehalogenase, type II  46.22 
 
 		 227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  47.83 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  43.84 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  43.84 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  43.81 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  48.43 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  47.75 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  47.75 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  42.45 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  43.96 
 
 		 224 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  44.14 
 
 		 227 aa  154  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  43 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  43.87 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  41.55 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  40.36 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3296  haloacid dehalogenase, type II  42.51 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  43.26 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  40 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  41.31 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  40.53 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  41 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  41.98 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  41.51 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  41.81 
 
 		 229 aa  138  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  39.47 
 
 		 255 aa  138  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  34.55 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  37.9 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02361  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_5G14640)  33.61 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  30.41 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  32.67 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  32.34 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  33.16 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2254  haloacid dehalogenase, type II  31.19 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00115148  normal  0.719984 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  32.18 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  33.5 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  29.7 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  27.64 
 
 		 230 aa  95.5  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  30.3 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  35.03 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  26.91 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  23.66 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1673  haloacid dehalogenase, type II  31.12 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  27.6 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  29.06 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  28.3 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  26.36 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  26.63 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  27.31 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  26.34 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  31.86 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  23.28 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  30.25 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  25.99 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  30.25 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  27.15 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  31.55 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  29.61 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  24.52 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  29.09 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  25.13 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4869  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.57 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172996  normal  0.422737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.81 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.57 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.35 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  29.29 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  28.06 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  27.52 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>