242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2142 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 226 aa  470  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1673  haloacid dehalogenase, type II  52.91 
 
 		 223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  47.51 
 
 		 228 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  47.93 
 
 		 228 aa  224  6e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2254  haloacid dehalogenase, type II  43.95 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00115148  normal  0.719984 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  44.7 
 
 		 225 aa  211  5.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  46.67 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  41.74 
 
 		 222 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  37.1 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  32.74 
 
 		 229 aa  131  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  32.74 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  31.39 
 
 		 222 aa  128  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  36.98 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02361  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_5G14640)  33.19 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  29.68 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  31.67 
 
 		 228 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  31.63 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  28.77 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  32.63 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2046  haloacid dehalogenase, type II  29.21 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  32.98 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3296  haloacid dehalogenase, type II  32.98 
 
 		 224 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  31.75 
 
 		 226 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  30.2 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  30.7 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  26.55 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  34.3 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  32.45 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  29.49 
 
 		 241 aa  105  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  30.92 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  31 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  31 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  31.44 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  30 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  31.25 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  31.08 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  29.22 
 
 		 270 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  31.63 
 
 		 262 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  29.22 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  29.22 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  29.22 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  28.7 
 
 		 198 aa  98.2  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  30.73 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  28.25 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  30.14 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  30.61 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  27.7 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  30.05 
 
 		 260 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  30.32 
 
 		 220 aa  96.3  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  29.68 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  28.31 
 
 		 253 aa  95.1  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  29 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  29.86 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  32.14 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  30.5 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  30.57 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  27.12 
 
 		 271 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  28.51 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 		 237 aa  92  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  26.24 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  27.85 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  29.38 
 
 		 227 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  27.85 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  27.85 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1995  haloacid dehalogenase, type II  29.56 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.018403  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  27.4 
 
 		 253 aa  88.6  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  29.76 
 
 		 260 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  30.05 
 
 		 267 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  30.05 
 
 		 267 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  30.05 
 
 		 258 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  30.05 
 
 		 267 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  30.05 
 
 		 267 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3582  haloacid dehalogenase, type II  28.33 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  26.36 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  26.44 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  26.48 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  26.7 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  24.77 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  25.88 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  28.89 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  28.14 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  28.24 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  27.01 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  29.34 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  24.55 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  25.56 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02344  Cryptic haloacid dehalogenase 1  31.62 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.906915  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  27.39 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  26.96 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  24.53 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  26.07 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.61 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.92 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  27.55 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  24.76 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0527  hydrolase  30.83 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  26 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  26 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  23.89 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>