261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4679 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 246 aa  500  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  65.57 
 
 		 251 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  55.23 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  48.97 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  48.97 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  41.06 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  40.99 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  46.73 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  40.95 
 
 		 255 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  40.09 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  40.95 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  40.95 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  45.5 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  40.95 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  40.58 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  43.12 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  41.92 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  40 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  40 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  40.17 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  40.26 
 
 		 225 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  39.37 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  42.5 
 
 		 232 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  42.5 
 
 		 232 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  41.92 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  41.92 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  41.92 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  41.92 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  41.92 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  41.92 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  40.19 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  39.05 
 
 		 253 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  42 
 
 		 233 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  43.28 
 
 		 229 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  46.46 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  39.9 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  40.59 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  42.56 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  39.92 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  44.72 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1995  haloacid dehalogenase, type II  42.93 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.018403  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  40 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  42.49 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3582  haloacid dehalogenase, type II  37.38 
 
 		 255 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  39.6 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  41.43 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  42.05 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  40.85 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  40 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  34.17 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3296  haloacid dehalogenase, type II  38.62 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2046  haloacid dehalogenase, type II  35.5 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  36 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  38.62 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  40.72 
 
 		 224 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  32.63 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  45.08 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  34.03 
 
 		 224 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02361  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_5G14640)  31.34 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  31.28 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  37.31 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  36.55 
 
 		 226 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  31.88 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  30.74 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1673  haloacid dehalogenase, type II  39.18 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2254  haloacid dehalogenase, type II  30.17 
 
 		 233 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00115148  normal  0.719984 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  35.15 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  27.84 
 
 		 230 aa  95.5  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  27.46 
 
 		 227 aa  94.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  30.29 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  29.96 
 
 		 198 aa  88.2  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  28.43 
 
 		 227 aa  86.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  31.19 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  30.69 
 
 		 234 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  27.98 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  26.97 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  28.21 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  28.35 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  29.23 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  28 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  29.47 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.5 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  24.74 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  29.13 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  28.22 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  28.22 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  27.41 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  28.22 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  27.41 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  26.94 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  25.79 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  27.23 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  24.74 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.28 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  29.06 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  25.89 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  27.32 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  33.98 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>