277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1235 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 232 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  99.57 
 
 		 232 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  90.48 
 
 		 233 aa  434  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  75.88 
 
 		 233 aa  367  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  75.56 
 
 		 237 aa  359  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  64 
 
 		 262 aa  308  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  61.98 
 
 		 270 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  60.96 
 
 		 253 aa  284  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  60.09 
 
 		 255 aa  279  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  59.5 
 
 		 271 aa  279  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  59.65 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  59.65 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  59.65 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  58.19 
 
 		 236 aa  274  9e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  57.89 
 
 		 253 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  57.89 
 
 		 253 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  61.5 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  57.85 
 
 		 239 aa  265  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  56.76 
 
 		 242 aa  263  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  61.14 
 
 		 258 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  61.5 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  61.5 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  61.5 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  61.5 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  61.5 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1995  haloacid dehalogenase, type II  62.5 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.018403  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  55 
 
 		 225 aa  241  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3582  haloacid dehalogenase, type II  53.28 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  53.71 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2046  haloacid dehalogenase, type II  45.33 
 
 		 227 aa  228  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  46.86 
 
 		 237 aa  214  9e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  43.36 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  43.38 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  43.38 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  47.95 
 
 		 226 aa  177  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  47.95 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  48.4 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  44.6 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  44.14 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  41.26 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  42.18 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  42.03 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  42.51 
 
 		 224 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  43 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  40.44 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3296  haloacid dehalogenase, type II  42.03 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  41.78 
 
 		 247 aa  151  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  41.67 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  43.2 
 
 		 227 aa  148  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  36.28 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  44.76 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  41.48 
 
 		 229 aa  145  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  41 
 
 		 246 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  41.23 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  41.23 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  36.7 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  34.69 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  32.84 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02361  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_5G14640)  32.49 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  30.88 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  28.64 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  35.47 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  31 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  32.67 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  30.94 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  30.4 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  30.3 
 
 		 227 aa  98.2  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2254  haloacid dehalogenase, type II  28.32 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00115148  normal  0.719984 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  35.03 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1673  haloacid dehalogenase, type II  33.16 
 
 		 223 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  29.09 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  28.3 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  24.55 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  28.51 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  28.3 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  26.46 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  28.14 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  28.85 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  27.31 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  27.51 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  28.28 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  25.86 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  28.92 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  30.8 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  25.81 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  28.07 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  28.06 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  28.71 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  28.86 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  30.64 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  31.02 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  28.83 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4869  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.57 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172996  normal  0.422737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  30.52 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  31.07 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>