More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3802 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 235 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  74.79 
 
 		 234 aa  362  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  70.94 
 
 		 234 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  34.6 
 
 		 279 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  33.67 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  29.78 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  30.73 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  34.69 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  31.44 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  33.63 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  31 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  33.17 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  30.91 
 
 		 297 aa  96.7  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  30.91 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  31.66 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  31.75 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  32.34 
 
 		 222 aa  95.9  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  31.41 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  30.17 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  30.61 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  33 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  31.07 
 
 		 222 aa  92.4  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  30.39 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  31.55 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  31.55 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  30.1 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  29.21 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  30.85 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  29.5 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  30.35 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  31.55 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  30.35 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  30.35 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  29.85 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  29.85 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  29.9 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  28.86 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  28.05 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  29.21 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.8 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  28.22 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  27.56 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  26.4 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  27.11 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  26.4 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  27.8 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  24.56 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  29.76 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.5 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  29.88 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  32.64 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6165  hydrolase  26.5 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.111596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  29.17 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  26.22 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  26.64 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  26.4 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  30.28 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  27.4 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  27.05 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  28.06 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  28.06 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  24.56 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.74 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  23.9 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  26.09 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  25.49 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  25.82 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  27.05 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  27.05 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  24.77 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  25.6 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  25.6 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  26.57 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  32.57 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  26.67 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  26.24 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  25.49 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  25.56 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  25.45 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  31.93 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  22.77 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  26.6 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  26.48 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  26.11 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  24.9 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  27.43 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  26.11 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1673  haloacid dehalogenase, type II  28.19 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  29.68 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  22.9 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  26.03 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  22.77 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  27.8 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  28.06 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  26.99 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  27.36 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>