159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5598 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 222 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  91.89 
 
 		 222 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  86.04 
 
 		 222 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  83.33 
 
 		 222 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  80.63 
 
 		 222 aa  394  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  79.73 
 
 		 222 aa  391  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  78.83 
 
 		 222 aa  384  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  77.48 
 
 		 222 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  78.18 
 
 		 234 aa  367  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  66.36 
 
 		 221 aa  324  6e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  64.86 
 
 		 222 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  64.86 
 
 		 222 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  64.86 
 
 		 222 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  64.86 
 
 		 222 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  64.41 
 
 		 222 aa  318  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  61.71 
 
 		 222 aa  309  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  62.73 
 
 		 221 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  63.18 
 
 		 221 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  62.33 
 
 		 222 aa  304  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  62.61 
 
 		 222 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  60.99 
 
 		 222 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  62.44 
 
 		 223 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  59.91 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  59.01 
 
 		 222 aa  292  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  59.46 
 
 		 222 aa  292  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  62.73 
 
 		 224 aa  288  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  59.01 
 
 		 222 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  29.44 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  29.7 
 
 		 234 aa  94.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  27.78 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  29.91 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  30.39 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  32.02 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  29.21 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  27.03 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  27.91 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  29.61 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  23.64 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  27.48 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  23.64 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  28.04 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.68 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  28.16 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  25.24 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  25.99 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  26.53 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  27.49 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  29.35 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  29.35 
 
 		 243 aa  62  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.54 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.71 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.69 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  31.52 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  25.82 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  26.84 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.6 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  26.67 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  26.19 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  26.19 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  25.89 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  27.92 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  27.92 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  27.92 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  26.77 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  25.91 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  26.17 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  30.89 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  30.63 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.77 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  26.32 
 
 		 260 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  26.9 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  24.39 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  25.45 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  24.12 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  25.22 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6165  hydrolase  26.79 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.111596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  25.12 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  26.54 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  24.44 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  25.71 
 
 		 253 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  25.55 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  22.67 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  24.2 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  24.2 
 
 		 316 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  26.47 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  31.62 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  24.2 
 
 		 346 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  24.2 
 
 		 346 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  24.2 
 
 		 344 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  24.2 
 
 		 336 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  26.89 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  21.94 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  29.79 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>