145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6165 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6165  hydrolase  100 
 
 		 233 aa  484  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.111596 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  29.28 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  30.14 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  26.43 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  27.35 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  26.5 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  29.17 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  25.68 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0527  hydrolase  25.5 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  36.63 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  23.83 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  24.23 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  35.42 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  27.16 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  29.06 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  27.4 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  27.16 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  27.16 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  27.4 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  26.83 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  27.4 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  24.67 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  34.02 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  29.36 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  26.92 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  26.92 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  25.22 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  33.01 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  28.24 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  22.83 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1501  hydrolase  26.34 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.401129 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  22.83 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  25.78 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  27.44 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  27.88 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  27.39 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  26.79 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  28.27 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  34.52 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  23.11 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  28.11 
 
 		 222 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.43 
 
 		 239 aa  52  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  27.23 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  28.73 
 
 		 233 aa  52  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  26.87 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  34.52 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  34.52 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  24.79 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  22.83 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  22.83 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  26.89 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  25.89 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  24.79 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  23.39 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  23.39 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.35 
 
 		 245 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  22.22 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  32.29 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  27.44 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  27.39 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  25.59 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  28.72 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  30.97 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  27.87 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  33.77 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  25.54 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  26.81 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  26.15 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.08 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  30.09 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  27.41 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  25.65 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  30.38 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  25.33 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  25.59 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  25.65 
 
 		 316 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  26.04 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  22.6 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  25.65 
 
 		 336 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.28 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  25.65 
 
 		 346 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  25.65 
 
 		 346 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  25.65 
 
 		 344 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  30.56 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  23.74 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  24.78 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  24.53 
 
 		 242 aa  45.1  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  27.83 
 
 		 266 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  26.64 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  23.83 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  28.96 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  23.42 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>