More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0322 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  100 
 
 		 234 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  81.62 
 
 		 234 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  74.79 
 
 		 235 aa  362  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  34.84 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  31.48 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  34.27 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  31.7 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  33.63 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  31.63 
 
 		 247 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  34.03 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  32.29 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  32.16 
 
 		 297 aa  102  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  32.16 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  31.17 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  30.74 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  33.5 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  29 
 
 		 222 aa  98.6  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  32.84 
 
 		 222 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  31.16 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  31 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  31 
 
 		 222 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  31 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  31 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  29.7 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  30.5 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  31.37 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  32.21 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  30.73 
 
 		 221 aa  91.7  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  29.69 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  30.05 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  29.5 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  30.8 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  28.08 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  30.29 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  28.71 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  27.5 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  28.43 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  31.55 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  31.55 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  27.41 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  31.95 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  28 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  27.41 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  28.22 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  29 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  28.69 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  27.4 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  28.24 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  34.03 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  28.19 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6165  hydrolase  27.35 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.111596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.5 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  28.08 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.77 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  30.59 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  28.05 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  29.38 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  29.38 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  28.91 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  27.94 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  27.96 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  30.72 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  27.96 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  26.11 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  28.44 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  27.63 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  27.61 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  25.59 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  27.14 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  28.43 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  26.67 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  28.43 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  28.77 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.94 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  26.76 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  27.88 
 
 		 260 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  27.63 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.36 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  31.05 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  26.2 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  24.4 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  29.32 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.63 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  27.4 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.48 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.31 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  25.44 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  28.64 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  25.76 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  27.7 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  30.16 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  28.33 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  27.13 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>