66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2947 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 224 aa  472  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  65 
 
 		 221 aa  301  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  62.73 
 
 		 222 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  62.73 
 
 		 222 aa  287  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  61.36 
 
 		 222 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  61.09 
 
 		 222 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  58.9 
 
 		 221 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  62.9 
 
 		 222 aa  284  9e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  57.99 
 
 		 221 aa  280  9e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  61.09 
 
 		 222 aa  279  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  58.56 
 
 		 223 aa  279  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  60.55 
 
 		 222 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  60.27 
 
 		 222 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  60.27 
 
 		 222 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  59.82 
 
 		 222 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  59.82 
 
 		 222 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  59.82 
 
 		 222 aa  274  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  59.63 
 
 		 222 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  58.82 
 
 		 222 aa  271  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  60.36 
 
 		 234 aa  271  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  59.82 
 
 		 222 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  58.9 
 
 		 222 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  56.62 
 
 		 222 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  56.16 
 
 		 222 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  53.12 
 
 		 222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  55.25 
 
 		 222 aa  250  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  56.16 
 
 		 222 aa  244  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 		 279 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  28.86 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  27.5 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  25.64 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  29.65 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  26.2 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  26.74 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  25.89 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  27.04 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  25.13 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  23.68 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  21.69 
 
 		 234 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  21.08 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  25 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  29.85 
 
 		 363 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  26.55 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  26.84 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  25.87 
 
 		 255 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  25.87 
 
 		 255 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  25.87 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  27.32 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  22.09 
 
 		 224 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  27.32 
 
 		 297 aa  48.9  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  21.74 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  23.68 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  25.57 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  28.02 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  28.02 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  23.73 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  21.67 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0477  HAD superfamily hydrolase  34.18 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.992519  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  24.49 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  24.64 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.88 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  23.15 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  25.71 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  25.38 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1501  hydrolase  27.27 
 
 		 223 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.401129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>