274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4737 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 
279 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  34.84 
 
 
234 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  34.6 
 
 
235 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  31.22 
 
 
234 aa  135  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  32.06 
 
 
231 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  33.78 
 
 
222 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  33.78 
 
 
222 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  33.67 
 
 
223 aa  122  8e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  30.45 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  30.77 
 
 
222 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 
222 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  32.43 
 
 
222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  31.08 
 
 
222 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  29.44 
 
 
222 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  31.48 
 
 
221 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  31.98 
 
 
222 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  30.7 
 
 
222 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  30.53 
 
 
222 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  33.51 
 
 
222 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 
222 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  30.37 
 
 
230 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  29.3 
 
 
234 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  29.3 
 
 
222 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  29.46 
 
 
247 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 
222 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 
222 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  28.7 
 
 
221 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  29.86 
 
 
222 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  28.83 
 
 
222 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  27.78 
 
 
221 aa  92.8  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  30.32 
 
 
223 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  27.27 
 
 
243 aa  89.4  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  26.73 
 
 
297 aa  89.4  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 
224 aa  85.9  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  31.94 
 
 
225 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  25.76 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  26.55 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  26.99 
 
 
234 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  29.76 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6165  hydrolase  30.14 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.111596 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  26.21 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  27.19 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  25.13 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  27.72 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  27.5 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  27.5 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  26.6 
 
 
253 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  26.6 
 
 
253 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  30.92 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  31.46 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  29.27 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  26 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  28.39 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  28.96 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  24.63 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.14 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  24.78 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  26.11 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  26.11 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  26.11 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.12 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  27.49 
 
 
232 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  25.24 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  28.92 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  28.92 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  26.09 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  25.73 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  28.92 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  25.25 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  25.96 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  24.88 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  27.36 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  25.25 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  24.52 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  24.88 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  25.23 
 
 
242 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  25.71 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  25.62 
 
 
253 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  24.2 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.77 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  24.64 
 
 
240 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  24.64 
 
 
336 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  24.64 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  24.64 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  27.43 
 
 
222 aa  63.5  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  24.64 
 
 
344 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  24.64 
 
 
316 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  24.29 
 
 
229 aa  63.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  25.73 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  24.07 
 
 
228 aa  63.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  25.84 
 
 
242 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  28.76 
 
 
234 aa  63.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  24.76 
 
 
240 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  24.39 
 
 
239 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  25.69 
 
 
271 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>