212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0108 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 239 aa  477  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  83.48 
 
 		 233 aa  394  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  76.96 
 
 		 234 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  79.21 
 
 		 203 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  79.21 
 
 		 203 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  54.7 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  56.72 
 
 		 240 aa  248  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  56.72 
 
 		 346 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  56.72 
 
 		 346 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  56.72 
 
 		 316 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  56.72 
 
 		 344 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  56.49 
 
 		 336 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  55.04 
 
 		 240 aa  241  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  52.14 
 
 		 242 aa  241  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  53.25 
 
 		 239 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  55 
 
 		 241 aa  237  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  55 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  48.96 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  54.74 
 
 		 240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  51.46 
 
 		 240 aa  232  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  57.02 
 
 		 245 aa  232  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  53.02 
 
 		 240 aa  231  7.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  53.88 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  49.79 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  53.45 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  53.45 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  53.68 
 
 		 240 aa  228  9e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  53.88 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  48.93 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  48.95 
 
 		 242 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  54.27 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  51.08 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  53.02 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  46.32 
 
 		 233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  46.32 
 
 		 233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  52.54 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  48.71 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  53.02 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  48.52 
 
 		 242 aa  191  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  42.55 
 
 		 232 aa  168  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  56.08 
 
 		 149 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  45.45 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  43.88 
 
 		 233 aa  158  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  43.59 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  43.88 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  36.15 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  34.76 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  29.36 
 
 		 234 aa  98.6  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  29.79 
 
 		 234 aa  98.6  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  31.65 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  60.81 
 
 		 99 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  27.51 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  40.15 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  26.98 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  31.2 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  42.86 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  41.67 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  25.91 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  27.16 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  35.57 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  21.4 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  31.33 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  31.58 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  26.01 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  27.36 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  28.21 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  32.52 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  33.57 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  29.07 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  24.88 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  26.38 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  24.88 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  27.95 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  23.28 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  26.5 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  27.43 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  29.18 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  27.72 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.09 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  27.19 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  24.68 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  34.45 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  32.89 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  31.45 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  29.72 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  28.83 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  24.68 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  24.68 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4869  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.82 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172996  normal  0.422737 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  27.56 
 
 		 229 aa  53.1  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  33.08 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  23.29 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.27 
 
 		 241 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  32.41 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>