165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3414 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 233 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  84.55 
 
 		 233 aa  371  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  62.66 
 
 		 233 aa  261  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  60 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  51.71 
 
 		 242 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  50.86 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  52.81 
 
 		 240 aa  221  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  51.49 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  49.57 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  49.57 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  49.57 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  53.68 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  49.57 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  49.57 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  47.84 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 316 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 346 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 346 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 344 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 336 aa  201  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  48.51 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  46.98 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  46.12 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  45.69 
 
 		 241 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  46.52 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  42.24 
 
 		 240 aa  181  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  48.71 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  41.03 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  47.06 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  43.29 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  40.77 
 
 		 241 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  40.6 
 
 		 242 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  44.26 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  42.06 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  45.99 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  43.59 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  48.51 
 
 		 203 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  48.51 
 
 		 203 aa  165  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  43.04 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  43.04 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  40.76 
 
 		 241 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  37.66 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  50.71 
 
 		 149 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  35.43 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  33.98 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  32.61 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  26.64 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  26.64 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  32.06 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  52.11 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  29.28 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  32.35 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  31.1 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  29.13 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  28.64 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  28.02 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  31.61 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  29.5 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  30.38 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  30.38 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  29.36 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  29.15 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  29.39 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  29.39 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  28.95 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  28.71 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  28.46 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.57 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  24.36 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  30.43 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  24.36 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  27.63 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  25.73 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  28.39 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  30.99 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  27.04 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  36.54 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  27.04 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  38.36 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  26.89 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  25.85 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  26.61 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  27.75 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  27.2 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  30.19 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  32.21 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  26.61 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  30.73 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  26.61 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  45 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  28.38 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  28.77 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  29.38 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  29.38 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>