216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5331 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 233 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  64.81 
 
 		 233 aa  274  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  62.66 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  53.02 
 
 		 239 aa  234  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  53.88 
 
 		 266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  53.88 
 
 		 266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  53.45 
 
 		 240 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  52.59 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  54.31 
 
 		 266 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  50.85 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  53.45 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  55.7 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  50.21 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  48.73 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  51.44 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  57.07 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  48.09 
 
 		 245 aa  194  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  51.43 
 
 		 240 aa  191  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  51.43 
 
 		 316 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  51.43 
 
 		 346 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  51.43 
 
 		 346 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  51.43 
 
 		 344 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  51.43 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  44.64 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  44.78 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  40.77 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  41.28 
 
 		 241 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  40.77 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  43.35 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  42.24 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  41.81 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  46.31 
 
 		 240 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  41.38 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  41.38 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  43.22 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  44.02 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  43.93 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  46.12 
 
 		 234 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  43.04 
 
 		 242 aa  158  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  42.16 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  42.16 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  46.77 
 
 		 203 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  46.77 
 
 		 203 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  36.52 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  30.59 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  48.65 
 
 		 149 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  33 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  33.92 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  60.56 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  27.9 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  27.47 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  34.62 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  31.68 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  29.91 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  34.18 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  30.9 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  27.66 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  31.74 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  31.74 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  31.22 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  27.04 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  31.78 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  30.87 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  31.71 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  31.65 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  29.76 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  30.2 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  29.76 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  27.44 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  29.76 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  29.15 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  29.27 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  27.85 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  29.76 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  30.04 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  33.82 
 
 		 225 aa  62  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  30.58 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  30.41 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  28.21 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  28.81 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  26.48 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  30.8 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  29.22 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.73 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  29.95 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  29.95 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  28.51 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3296  haloacid dehalogenase, type II  28.92 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  28.92 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  28.51 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  27.93 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  32.64 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  26.46 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  33.57 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  28.29 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>