187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3008 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 248 aa  483  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  51.29 
 
 		 239 aa  238  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  50 
 
 		 242 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  60 
 
 		 233 aa  235  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  53.19 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  52.14 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  52.4 
 
 		 266 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  52.4 
 
 		 266 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  53.91 
 
 		 240 aa  228  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  51.97 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  59.13 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  53.25 
 
 		 240 aa  224  9e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  53.25 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  53.25 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  53.25 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  53.25 
 
 		 344 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  53.25 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  50.22 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  50 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  50.22 
 
 		 240 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  55.7 
 
 		 233 aa  214  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  48.48 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  49.35 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  48.05 
 
 		 241 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  48.26 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  44.1 
 
 		 241 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  45.22 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  48.76 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  49.58 
 
 		 233 aa  195  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  43.28 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  42.67 
 
 		 242 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  42.49 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  46.54 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  41.99 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  42.49 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  43.97 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  45.45 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  44.44 
 
 		 241 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  47.16 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  43.81 
 
 		 235 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  49.01 
 
 		 203 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  49.01 
 
 		 203 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  44.73 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  50.35 
 
 		 149 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  36.73 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  36.05 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  31.62 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  33.62 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  57.5 
 
 		 99 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  27.39 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  27.39 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  31.66 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  28.26 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  26.36 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  30.65 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  32 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  34.42 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  31.82 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  31.09 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  32.09 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  27.5 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  30.2 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  29.47 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  27.71 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  29.59 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  32.71 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  31.19 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  29.21 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  31.07 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3296  haloacid dehalogenase, type II  30.73 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  28.1 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.99 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  25.65 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  37.74 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  24.69 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  27.76 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  31.19 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  30.92 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  28.23 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  29.85 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  27.87 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  29.19 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  27.64 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  31.78 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  33 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  26.63 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  30.36 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  31.78 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  31.78 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  31.78 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  31.78 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  31.78 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  27.86 
 
 		 247 aa  52.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  32.34 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 271 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  28.85 
 
 		 222 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  30.34 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  30.34 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  30.34 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>