141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4415 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 
222 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  87.39 
 
 
222 aa  424  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  86.04 
 
 
222 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  79.73 
 
 
222 aa  390  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  80.18 
 
 
222 aa  387  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  78.38 
 
 
222 aa  384  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  76.13 
 
 
222 aa  371  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  75.68 
 
 
222 aa  370  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  74.43 
 
 
234 aa  355  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  65.3 
 
 
221 aa  313  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  63.96 
 
 
222 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  63.96 
 
 
222 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  63.96 
 
 
222 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  63.96 
 
 
222 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  63.96 
 
 
222 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  65.75 
 
 
221 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  64.84 
 
 
221 aa  305  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  61.26 
 
 
222 aa  299  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  60.99 
 
 
222 aa  298  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  60.99 
 
 
222 aa  298  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  61.54 
 
 
223 aa  296  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  61.71 
 
 
222 aa  295  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  61.36 
 
 
224 aa  285  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  57.66 
 
 
222 aa  279  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  57.66 
 
 
222 aa  279  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  57.66 
 
 
222 aa  277  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  56.76 
 
 
222 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 
279 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  31.16 
 
 
234 aa  98.2  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  31.1 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 
223 aa  92.8  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  33.67 
 
 
234 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  31.55 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  29.72 
 
 
242 aa  89  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  30.1 
 
 
241 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  28.97 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  25.32 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  29.03 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  28.16 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  24.75 
 
 
247 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  28 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  24.65 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  27.51 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  24.19 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  28.36 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  27.75 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  27.75 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.58 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.83 
 
 
238 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  25.47 
 
 
236 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  26.83 
 
 
232 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.29 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.8 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  24.79 
 
 
241 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  25.56 
 
 
233 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  29.35 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  25.7 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  25.7 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  25.23 
 
 
255 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  25.12 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  25.86 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  26.16 
 
 
237 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.9 
 
 
248 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  33.03 
 
 
256 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  26.02 
 
 
243 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  27.17 
 
 
240 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  26.05 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  26.19 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  24.85 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  26.07 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  27.84 
 
 
266 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  23.26 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  27.84 
 
 
266 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  27.84 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  24.61 
 
 
230 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  29.49 
 
 
248 aa  48.9  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  22.22 
 
 
235 aa  48.9  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  25.57 
 
 
346 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  25.57 
 
 
346 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  25.57 
 
 
336 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  20.1 
 
 
222 aa  48.9  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  25.13 
 
 
252 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  25.57 
 
 
344 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  23.77 
 
 
240 aa  48.9  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  25.57 
 
 
316 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  23.35 
 
 
239 aa  48.5  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  25.57 
 
 
240 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  23.98 
 
 
226 aa  48.5  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  26.14 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  30.89 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  24.85 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  30.25 
 
 
256 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  24.77 
 
 
253 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6165  hydrolase  26.15 
 
 
233 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.111596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  23.83 
 
 
251 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  23.79 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  28.26 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.61 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  22.44 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  26.09 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>