160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2716 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  100 
 
 
227 aa  447  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  56.58 
 
 
230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  35.56 
 
 
245 aa  115  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  34.6 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  34.6 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  34.18 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  34.32 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  33.47 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  33.76 
 
 
240 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  36.24 
 
 
228 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  33.62 
 
 
241 aa  111  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  34.18 
 
 
252 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  33.62 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  34.18 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  32.3 
 
 
233 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  32.3 
 
 
233 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  34.35 
 
 
233 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  32.87 
 
 
241 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  34.05 
 
 
239 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  37.34 
 
 
233 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  34.07 
 
 
240 aa  105  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  34.76 
 
 
239 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  33.91 
 
 
240 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  35.71 
 
 
237 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  33.19 
 
 
242 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  42.95 
 
 
234 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  35.27 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  32.91 
 
 
240 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  32.91 
 
 
316 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  32.91 
 
 
346 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  32.91 
 
 
346 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  32.91 
 
 
344 aa  98.6  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  32.91 
 
 
336 aa  98.6  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  44.96 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  44.96 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  32.9 
 
 
232 aa  95.1  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  33.5 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  31.4 
 
 
242 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  34.06 
 
 
235 aa  93.2  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  31.06 
 
 
241 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  30.15 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  33.62 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  32.61 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.392985 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  42.16 
 
 
263 aa  78.2  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  37.04 
 
 
149 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  33.04 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  31.2 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  26.09 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  25.65 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  33.92 
 
 
233 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  28.04 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  30.73 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  28.42 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  33.61 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  27.51 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  30.32 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  28.42 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  27.51 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  31.12 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  29.47 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  27 
 
 
229 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  27 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  31.58 
 
 
226 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  31 
 
 
226 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 
221 aa  61.6  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  27.51 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  27.15 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  29.53 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  39.62 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  29.28 
 
 
222 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  29.28 
 
 
222 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  28.11 
 
 
221 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  33.07 
 
 
222 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  26.64 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  30.57 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  28.64 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  35.71 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  39.81 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  32.41 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  28.21 
 
 
223 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  32.89 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  25.43 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  32.28 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  32.28 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02344  Cryptic haloacid dehalogenase 1  32.95 
 
 
123 aa  55.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.906915  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  27.92 
 
 
228 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  23.71 
 
 
231 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  28.71 
 
 
232 aa  55.1  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  26.61 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  32.68 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  28.36 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  26.18 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  23.35 
 
 
243 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  29.92 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.37 
 
 
239 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  31 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  26.27 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  28.21 
 
 
255 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  28.21 
 
 
255 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>