193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1791 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  100 
 
 		 240 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  57.38 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  57.52 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  56.2 
 
 		 240 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  55 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  56.17 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  55.95 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  55.95 
 
 		 316 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  54.96 
 
 		 266 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  54.96 
 
 		 266 aa  260  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  55.95 
 
 		 344 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  55.95 
 
 		 336 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  55.95 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  55.95 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  57.08 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  52.77 
 
 		 239 aa  254  9e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  56.25 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  52.79 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  48.13 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  48.71 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  46.12 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  45.29 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  45.29 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  47.23 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  44.54 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  44.4 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  44.54 
 
 		 241 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  44.4 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  50.97 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  50.97 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  46.12 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  46.51 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  48.91 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  44.2 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  44.16 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  42.67 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  42.24 
 
 		 241 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  56.25 
 
 		 149 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  45.04 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  45.3 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  49.02 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  47.06 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  46.31 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  42.26 
 
 		 242 aa  158  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  37.5 
 
 		 232 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  34.84 
 
 		 263 aa  121  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  32.37 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  35.27 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  29.54 
 
 		 234 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  29.11 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  29.49 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  58.82 
 
 		 99 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  28.27 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  29.18 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  29.44 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  29.44 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  29.29 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  27.85 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.22 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  27.7 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  27.16 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  25 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  25.42 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  27.27 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  24.76 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  27.9 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  26.44 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  32.82 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  29.7 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  24.02 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  25.85 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  27.87 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  27.11 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  34.95 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  24.17 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.95 
 
 		 224 aa  52.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  28.22 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  35.35 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  27.09 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  27.57 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  26.57 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.93 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  31.16 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  27.09 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  29.17 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  27.09 
 
 		 232 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  31.97 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  29.17 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3296  haloacid dehalogenase, type II  27.23 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.1 
 
 		 241 aa  48.5  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  30.06 
 
 		 227 aa  48.5  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  27.23 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  27.54 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  27.54 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  27.37 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  27.54 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>