292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6135 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 234 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  99.15 
 
 		 234 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  32.62 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  31.78 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  31.78 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  31.9 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  31.86 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  32.63 
 
 		 252 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  32.2 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  30.08 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  28.25 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 346 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 336 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 316 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 346 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 344 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 242 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  27.71 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  31.3 
 
 		 227 aa  99.4  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  29.36 
 
 		 239 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  29.54 
 
 		 240 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  31.19 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  29.52 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  29.27 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  29.17 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  27.63 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  29.3 
 
 		 229 aa  93.6  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  29.13 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  28.29 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  28.45 
 
 		 233 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  27.95 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  27.19 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  30.15 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  27.43 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  27.19 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  31.16 
 
 		 247 aa  89  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  26.11 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  30.04 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  31.22 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  28.76 
 
 		 222 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  30.04 
 
 		 229 aa  89  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  29.02 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  28.7 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  27.7 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  28.76 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  31.58 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  28.25 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  28.32 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  26.41 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  26.99 
 
 		 227 aa  85.5  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  29 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  28.29 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  25.82 
 
 		 270 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  27.43 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  30.53 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  28.19 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  25.55 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  27.88 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  27.88 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  32 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  29.19 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  25.73 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  28.85 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  27.56 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  28.82 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  25.6 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  26.94 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  26.55 
 
 		 279 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  26.94 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  26.48 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  27.4 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  27.75 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  26.45 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  26.79 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  26.99 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  28.02 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  26.45 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  26.87 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  30.69 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  26.48 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  27.75 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  26.64 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  26.84 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  26.58 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  28 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  29.56 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  27.72 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2254  haloacid dehalogenase, type II  28.79 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00115148  normal  0.719984 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  25.43 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  27.11 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  29.54 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  27.93 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>