More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2254 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2254  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 233 aa  478  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00115148  normal  0.719984 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  70.8 
 
 		 228 aa  330  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  65.62 
 
 		 228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  62.21 
 
 		 225 aa  295  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  52.8 
 
 		 222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  48.85 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  43.95 
 
 		 226 aa  218  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  51.36 
 
 		 226 aa  218  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1673  haloacid dehalogenase, type II  48.43 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02361  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_5G14640)  35.53 
 
 		 237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  33.18 
 
 		 227 aa  131  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  36.67 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  30.7 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  33.49 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  33.8 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  33.64 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3296  haloacid dehalogenase, type II  36.19 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  36.19 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  36.73 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  30.73 
 
 		 227 aa  118  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  35.32 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  35.48 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  32.56 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  32.24 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  34.67 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  36.04 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  31.75 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  32.14 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  35.9 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  31.28 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  36.24 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  34.39 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  30.81 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  31.19 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  32.67 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  35.16 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  32.67 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  31.34 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  33.04 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  31.19 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  33.48 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  35.75 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  27.91 
 
 		 224 aa  98.6  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  29.72 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  32.57 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  30.77 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2046  haloacid dehalogenase, type II  28.38 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  31.03 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  31.25 
 
 		 262 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  28.32 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  28.32 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  32.11 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  29.82 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  29.82 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  28.93 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  30.83 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 270 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  29.74 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  30.77 
 
 		 260 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  30.77 
 
 		 267 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  30.77 
 
 		 267 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  30.77 
 
 		 267 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  30.77 
 
 		 267 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  29.39 
 
 		 253 aa  92.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  30.77 
 
 		 258 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1995  haloacid dehalogenase, type II  31.28 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.018403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  30.17 
 
 		 246 aa  91.7  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  28.72 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  27.19 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  30.91 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  27.48 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  29.13 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  29.13 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  30.88 
 
 		 253 aa  89  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  29.13 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  25.45 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  26.46 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3582  haloacid dehalogenase, type II  31.91 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  30.04 
 
 		 224 aa  85.1  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  27.06 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  28.79 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  27.44 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  28.28 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  28.36 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  25.79 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02344  Cryptic haloacid dehalogenase 1  31.9 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.906915  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  28.87 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.23 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  26.2 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  24.37 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  26.15 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  26.11 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>