137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4920 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  100 
 
 		 223 aa  431  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  43.64 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  40.1 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  34.09 
 
 		 225 aa  111  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  33.04 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  40.85 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  34.39 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  32.52 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  34.39 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  33.52 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  37.37 
 
 		 253 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  30.33 
 
 		 241 aa  95.9  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  30.65 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4869  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.16 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172996  normal  0.422737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  26.03 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  27.6 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  30.07 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  36.02 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  23.98 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  30.4 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  35.19 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  28.11 
 
 		 271 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  25.64 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  33.54 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  30.57 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  29.76 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  30.05 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  27.65 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  30.1 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  26.63 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  32.38 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  32.38 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  32.38 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  29 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  29 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  32.38 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  32.38 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  32.38 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  32.38 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  32.38 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  32.38 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  32.38 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  31.68 
 
 		 241 aa  62  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  32.38 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  24.64 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1673  haloacid dehalogenase, type II  34.38 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  31.68 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  24.64 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  30.2 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  29.33 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  31.07 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  33.57 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  28.7 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  31.07 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  31.07 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  38.14 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2254  haloacid dehalogenase, type II  28.23 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00115148  normal  0.719984 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  24.76 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  23.71 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02344  Cryptic haloacid dehalogenase 1  31.53 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.906915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  29.05 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  28.81 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  31.33 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  26.79 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  27.5 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  26.04 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  32.14 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  32.14 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  23.79 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  27.71 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  30.07 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3296  haloacid dehalogenase, type II  26.53 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  26.2 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1995  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.018403  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  32.43 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  28.46 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  28.46 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  34.51 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  26.13 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  26.63 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  23.4 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  22.76 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  26.69 
 
 		 300 aa  52  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  34.58 
 
 		 240 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  26.89 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  29.13 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  28.71 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  20.45 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  26.11 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  36.52 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  25.21 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  26.84 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  21.24 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  26.2 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  26.8 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  29.33 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  22.06 
 
 		 198 aa  48.5  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>