160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4869 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4869  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 
236 aa  443  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172996  normal  0.422737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  42.6 
 
 
223 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  33.79 
 
 
243 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  36.16 
 
 
223 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  35.85 
 
 
234 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  26.87 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  22.71 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  29.78 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  27.4 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  29.07 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  28 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  36.3 
 
 
226 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 
232 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 
232 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  31.61 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  37.31 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  25.94 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  28.57 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  31.34 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  32.32 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  23.22 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  36.57 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  23.98 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  29.73 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  25.12 
 
 
241 aa  62.4  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  28.51 
 
 
255 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  28.65 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  25.52 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  28.51 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  28.51 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  31.62 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  33.03 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  26.73 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  24.08 
 
 
240 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  23.08 
 
 
242 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  27.6 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  26.23 
 
 
227 aa  59.3  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  25.56 
 
 
230 aa  59.3  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  27.33 
 
 
228 aa  58.9  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  30.53 
 
 
260 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  27.12 
 
 
253 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  27.12 
 
 
253 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3582  haloacid dehalogenase, type II  25.41 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  21.13 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  21.13 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  35.82 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  24.64 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  27.68 
 
 
233 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  23.48 
 
 
249 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  24.61 
 
 
255 aa  55.8  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  27.54 
 
 
253 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  26.02 
 
 
220 aa  55.1  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  25.31 
 
 
217 aa  55.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  27.15 
 
 
271 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  30.28 
 
 
224 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2046  haloacid dehalogenase, type II  20.98 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  24.08 
 
 
227 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  30.22 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  30.36 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  30.36 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  30.36 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  30.36 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  30.36 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  30.36 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  33.82 
 
 
234 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  27.56 
 
 
227 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  35.88 
 
 
266 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  31.78 
 
 
213 aa  52.8  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  35.88 
 
 
252 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  24.87 
 
 
226 aa  52.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  21.74 
 
 
237 aa  52  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  29.7 
 
 
229 aa  52  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  36 
 
 
228 aa  52  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  27.78 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  37 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  32.35 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  32.35 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.05 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  32.11 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  34.18 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  34.07 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  30.19 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  24 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  23.67 
 
 
262 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  39.78 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  26.34 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  28.7 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  22.52 
 
 
226 aa  48.5  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  33.94 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02344  Cryptic haloacid dehalogenase 1  26.79 
 
 
123 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.906915  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  33.94 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  28.85 
 
 
213 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  33.33 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  33.94 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  33.33 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.13 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  27.61 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  24.77 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>