More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10473 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  45.21 
 
 		 227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  43.18 
 
 		 260 aa  185  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  41.47 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  39.81 
 
 		 253 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  34.56 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  34.1 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  33.79 
 
 		 224 aa  141  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  37.37 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  36.41 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  31.39 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  36.07 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02344  Cryptic haloacid dehalogenase 1  48.74 
 
 		 123 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.906915  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  32.59 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  30.23 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  29.95 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  29.46 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  32.67 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  31.65 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  29.95 
 
 		 225 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2254  haloacid dehalogenase, type II  31.19 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00115148  normal  0.719984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  26.48 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  26.48 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1673  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  27.15 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  27.65 
 
 		 224 aa  98.2  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 198 aa  96.3  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.65 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  27.78 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  29.17 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  28.44 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  26.85 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  24.22 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  23.85 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  27.98 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  29.09 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  29.09 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  27.78 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  27.7 
 
 		 226 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  23.98 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  25.23 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  26.67 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  27.31 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  26.36 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  26.63 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  27.96 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  25.57 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  26.51 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  24.56 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  26.36 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  27.96 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  26.63 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  26.63 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  26.63 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  26.63 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  24.56 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1995  haloacid dehalogenase, type II  27.64 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.018403  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  26.63 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  24.05 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  24.12 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  24.12 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  26.63 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  23.96 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  28.06 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  24.12 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  24.62 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  28.27 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  27.98 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  23.79 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  27.51 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  33.93 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  28.19 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  27.98 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  23.25 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  23.25 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  28.12 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  23.62 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  28.06 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2046  haloacid dehalogenase, type II  21.52 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  23.85 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  25.57 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  31.62 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  30.69 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4869  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.43 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172996  normal  0.422737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  28.26 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  27.44 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  31.21 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  31.21 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  24.37 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  23.94 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  24.62 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3296  haloacid dehalogenase, type II  23.94 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  29.61 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  33.61 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  26.56 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  30.83 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  26.47 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  26.04 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3582  haloacid dehalogenase, type II  22.82 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>