243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1654 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  100 
 
 		 251 aa  507  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  65.57 
 
 		 246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  55.56 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  40.24 
 
 		 228 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  47.4 
 
 		 229 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  47.4 
 
 		 229 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  47.24 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  39.23 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  44.95 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  43.19 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  44.95 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  44.95 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  44.44 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  43.94 
 
 		 253 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  43.94 
 
 		 253 aa  165  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  43.94 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  47.24 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  47.24 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  44.9 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  47.24 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  47.24 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  47.24 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  47.24 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  45.13 
 
 		 239 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  46.46 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  45.96 
 
 		 226 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  45.45 
 
 		 226 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  43.43 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0158  2-haloacid dehalogenase  43.15 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  41.78 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  42.03 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  41.55 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4516  haloacid dehalogenase, type II  35.55 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3582  haloacid dehalogenase, type II  39.37 
 
 		 255 aa  152  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  42.86 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1995  haloacid dehalogenase, type II  46.73 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.018403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  45.88 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  42.27 
 
 		 225 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3684  haloacid dehalogenase, type II  40.49 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0565  haloacid dehalogenase, type II  46.15 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0566  haloacid dehalogenase, type II  46.15 
 
 		 255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  42.49 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  42.19 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  41.12 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  44.22 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  40.93 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  43.72 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  41.79 
 
 		 229 aa  141  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  40.51 
 
 		 228 aa  138  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3296  haloacid dehalogenase, type II  39.15 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  39.15 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  35.94 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  38.66 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2046  haloacid dehalogenase, type II  33.83 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  34.83 
 
 		 237 aa  130  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  36.98 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1673  haloacid dehalogenase, type II  41.97 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  42.49 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  38.14 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  33.16 
 
 		 225 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  31.02 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  35.05 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2254  haloacid dehalogenase, type II  32.14 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00115148  normal  0.719984 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  32.31 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  34.85 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02361  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_5G14640)  33.33 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  34 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  28.65 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  29.23 
 
 		 227 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  26.9 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  30.15 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  30.15 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  27.78 
 
 		 222 aa  89  7e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  31.61 
 
 		 234 aa  89  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 198 aa  85.1  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  25.91 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  31.73 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  31.73 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  31.73 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  31.25 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  30.21 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  28.21 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  31.43 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  34.29 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  32.2 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  26.98 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  31.39 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  29.19 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  23.67 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  29.15 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  29.15 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  30.39 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  29.52 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  29.19 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  29.52 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  29.52 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  29.52 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  29.52 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  29.52 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  30.19 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>